More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2664 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  96.79 
 
 
405 aa  768    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
405 aa  817    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  97.28 
 
 
405 aa  770    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  75 
 
 
410 aa  621  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  74.75 
 
 
412 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  73.58 
 
 
406 aa  608  1e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  73.45 
 
 
438 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  62.34 
 
 
404 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  62.59 
 
 
429 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  62.34 
 
 
429 aa  514  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  62.09 
 
 
404 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  61.6 
 
 
418 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  61.35 
 
 
418 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  63.34 
 
 
405 aa  507  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  60.65 
 
 
404 aa  507  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  62.09 
 
 
410 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  60.85 
 
 
408 aa  501  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  60.6 
 
 
404 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  57.61 
 
 
404 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  58.27 
 
 
411 aa  477  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  57.11 
 
 
404 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  57.36 
 
 
404 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  57.14 
 
 
415 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  58.46 
 
 
404 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  55.28 
 
 
410 aa  462  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  57.18 
 
 
413 aa  461  9.999999999999999e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  50.5 
 
 
398 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  45.02 
 
 
411 aa  325  9e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  45.73 
 
 
398 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  42.11 
 
 
407 aa  279  8e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  41.25 
 
 
414 aa  271  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  39.9 
 
 
419 aa  262  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  41.38 
 
 
406 aa  256  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  38.93 
 
 
409 aa  256  5e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  40.1 
 
 
421 aa  252  9.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  39.7 
 
 
409 aa  250  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  40.35 
 
 
403 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  39.61 
 
 
432 aa  247  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  39.75 
 
 
420 aa  247  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  41.25 
 
 
429 aa  245  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  39.71 
 
 
419 aa  240  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  39.55 
 
 
406 aa  239  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  35.81 
 
 
400 aa  238  2e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  39.12 
 
 
380 aa  237  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  39.07 
 
 
410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1310  phosphoserine phosphatase SerB  48.81 
 
 
303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193327  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  53.81 
 
 
400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  53.33 
 
 
400 aa  233  6e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
435 aa  231  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1834  phosphoserine phosphatase SerB  39.39 
 
 
417 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0739277  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1853  phosphoserine phosphatase SerB  39.39 
 
 
417 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1900  phosphoserine phosphatase SerB  39.39 
 
 
417 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4276  phosphoserine phosphatase SerB  39.65 
 
 
410 aa  229  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2083  phosphoserine phosphatase SerB  39 
 
 
419 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726973  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  40.13 
 
 
306 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  40.13 
 
 
306 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  52.45 
 
 
326 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  50 
 
 
326 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  48.94 
 
 
285 aa  210  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  49.36 
 
 
310 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  49.15 
 
 
281 aa  210  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  49.79 
 
 
281 aa  208  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  48.94 
 
 
285 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  46.64 
 
 
317 aa  207  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  43.34 
 
 
279 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  47.35 
 
 
328 aa  203  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  48.75 
 
 
326 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  43.75 
 
 
281 aa  203  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  48.75 
 
 
326 aa  202  6e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  43.15 
 
 
316 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  43.15 
 
 
316 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  47.16 
 
 
325 aa  202  9e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  48.75 
 
 
326 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  43.75 
 
 
281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  47.84 
 
 
325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  47.16 
 
 
325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  50.96 
 
 
322 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  50.96 
 
 
322 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  50.96 
 
 
322 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  47.66 
 
 
284 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  50.96 
 
 
322 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  49.77 
 
 
322 aa  200  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  50.96 
 
 
322 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  50.96 
 
 
322 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  50.96 
 
 
322 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  50.96 
 
 
322 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  49.76 
 
 
306 aa  199  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  48.2 
 
 
322 aa  199  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  40 
 
 
316 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  49.1 
 
 
279 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  47.84 
 
 
279 aa  199  7.999999999999999e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  50.48 
 
 
322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  50 
 
 
279 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  46.32 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  49.76 
 
 
307 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  50 
 
 
322 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  50 
 
 
322 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  50 
 
 
322 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  50 
 
 
322 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  50 
 
 
322 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>