135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2632 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2632  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  528  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0680234  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1804  hypothetical protein  71.26 
 
 
265 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2290  hypothetical protein  69.35 
 
 
261 aa  346  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.47425e-05 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1073  hypothetical protein  59.77 
 
 
263 aa  324  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.780627  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2007  ABC-type transport system, permease component  55.82 
 
 
266 aa  295  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089276  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1139  hypothetical protein  38.13 
 
 
265 aa  208  7e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.529413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4760  hypothetical protein  39.84 
 
 
264 aa  201  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4653  hypothetical protein  38.67 
 
 
265 aa  197  1e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5050  hypothetical protein  38.67 
 
 
265 aa  197  1e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5081  hypothetical protein  38.67 
 
 
265 aa  197  1e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4673  hypothetical protein  38.67 
 
 
265 aa  197  2e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5079  hypothetical protein  38.67 
 
 
265 aa  197  2e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5084  hypothetical protein  38.82 
 
 
265 aa  196  2e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0161  hypothetical protein  38.67 
 
 
265 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4811  hypothetical protein  38.28 
 
 
265 aa  196  4e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5176  hypothetical protein  38.28 
 
 
265 aa  196  4e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3518  hypothetical protein  43.09 
 
 
257 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000832658  normal  0.16619 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4303  hypothetical protein  39.76 
 
 
258 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.121514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4241  hypothetical protein  40.16 
 
 
258 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0731  hypothetical protein  39.85 
 
 
262 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  2.07096e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0755  hypothetical protein  39.85 
 
 
262 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  3.02353e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15630  conserved hypothetical protein TIGR00245  36.47 
 
 
260 aa  184  1e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3461  hypothetical protein  36.9 
 
 
262 aa  182  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2510  hypothetical protein  39.45 
 
 
258 aa  181  8e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1727  hypothetical protein  36.4 
 
 
265 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0254  hypothetical protein  38.28 
 
 
251 aa  180  3e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.59378e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0900  hypothetical protein  38.82 
 
 
258 aa  179  3e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0279  hypothetical protein  39.13 
 
 
260 aa  174  2e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2456  hypothetical protein  36.58 
 
 
261 aa  173  3e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1218  hypothetical protein  36.19 
 
 
258 aa  170  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1835  hypothetical protein  41.15 
 
 
267 aa  169  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1069  hypothetical protein  36.98 
 
 
272 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.443958  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1311  hypothetical protein  36.98 
 
 
272 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1798  hypothetical protein  36.98 
 
 
272 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.539315  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2321  hypothetical protein  36.98 
 
 
272 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0097  hypothetical protein  36.98 
 
 
272 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2153  hypothetical protein  36.98 
 
 
272 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2190  hypothetical protein  36.98 
 
 
272 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1171  hypothetical protein  41.39 
 
 
261 aa  168  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.739375  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2266  hypothetical protein  36.6 
 
 
272 aa  168  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.336185  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0764  hypothetical protein  37.79 
 
 
269 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0571603 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0698  hypothetical protein  36.78 
 
 
269 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.217447 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0534  hypothetical protein  36.36 
 
 
267 aa  165  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2323  ABC transporter, inner membrane subunit  38.33 
 
 
268 aa  165  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1234  hypothetical protein  33.46 
 
 
261 aa  164  9e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0986  hypothetical protein  36.22 
 
 
268 aa  164  2e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1863  hypothetical protein  36.8 
 
 
268 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00500964  normal  0.0941942 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1807  hypothetical protein  36.94 
 
 
265 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162766  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1799  hypothetical protein  36.12 
 
 
267 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.551052 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1774  hypothetical protein  36.12 
 
 
267 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.113625  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6305  hypothetical protein  36.12 
 
 
267 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5072  putative ABC transporter, inner membrane subunit  35.74 
 
 
267 aa  161  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362537  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1087  hypothetical protein  33.72 
 
 
263 aa  160  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1713  hypothetical protein  34.87 
 
 
267 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1685  hypothetical protein  37.11 
 
 
267 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1497  hypothetical protein  35.11 
 
 
267 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0286332 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2539  hypothetical protein  36.17 
 
 
266 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0939059  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1437  hypothetical protein  38.79 
 
 
264 aa  152  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318799  normal  0.0549134 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1309  hypothetical protein  30.38 
 
 
259 aa  149  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1348  hypothetical protein  33.48 
 
 
264 aa  148  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2239  hypothetical protein  33.85 
 
 
263 aa  147  2e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255232  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7995  hypothetical protein  33.85 
 
 
263 aa  147  2e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138428  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3633  hypothetical protein  37.55 
 
 
265 aa  147  2e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0748  hypothetical protein  36.72 
 
 
272 aa  145  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0169  ABC transporter, permease protein, putative  39.91 
 
 
263 aa  143  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.645871  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1058  hypothetical protein  31.9 
 
 
261 aa  143  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0552  hypothetical protein  32.95 
 
 
259 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.417119  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0611  hypothetical protein  32.95 
 
 
259 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0567  hypothetical protein  32.95 
 
 
259 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0550  hypothetical protein  32.95 
 
 
259 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0557  hypothetical protein  32.95 
 
 
259 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.711318  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0076  hypothetical protein  35.91 
 
 
269 aa  142  8e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0298659  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0689  hypothetical protein  34.48 
 
 
257 aa  141  1e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.393246  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3122  hypothetical protein  36.6 
 
 
268 aa  141  1e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.859294  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0767  hypothetical protein  34.81 
 
 
263 aa  140  2e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00447  hypothetical protein  32.95 
 
 
259 aa  140  2e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3119  conserved hypothetical protein  32.95 
 
 
259 aa  140  2e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00442  predicted inner membrane protein  32.95 
 
 
259 aa  140  2e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0570  hypothetical protein  32.95 
 
 
259 aa  140  2e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0540  hypothetical protein  32.95 
 
 
259 aa  140  2e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0595  hypothetical protein  32.95 
 
 
259 aa  140  2e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3125  hypothetical protein  32.95 
 
 
259 aa  140  2e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101868 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2410  hypothetical protein  36.61 
 
 
265 aa  139  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0530  hypothetical protein  32.56 
 
 
259 aa  139  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0072  hypothetical protein  39.3 
 
 
263 aa  138  9e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0198  hypothetical protein  36.17 
 
 
268 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.68555 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0426  hypothetical protein  32.82 
 
 
259 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1097  hypothetical protein  33.2 
 
 
257 aa  137  3e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215237  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0080  ABC transporter permease  31.4 
 
 
266 aa  135  6e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1145  ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
265 aa  134  1e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  4.31161e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2020  hypothetical protein  35.9 
 
 
263 aa  133  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0165  hypothetical protein  39.47 
 
 
266 aa  132  4e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.980165  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0121  hypothetical protein  38.26 
 
 
266 aa  133  4e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4666  hypothetical protein  31.43 
 
 
257 aa  131  1e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A09  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.93 
 
 
251 aa  131  1e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  1.12109e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3829  putative ABC transport system permease protein  36.04 
 
 
263 aa  131  1e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  3.96404e-07 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1378  hypothetical protein  31.58 
 
 
242 aa  131  1e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0154277  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1627  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.93 
 
 
251 aa  130  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003828  ABC-type uncharacterized transport system permease component  37.96 
 
 
270 aa  128  8e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0731  hypothetical protein  34.14 
 
 
271 aa  128  9e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.146509 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>