More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2576 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  100 
 
 		 158 aa  334  2.9999999999999997e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  71.17 
 
 		 172 aa  235  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  64.88 
 
 		 165 aa  227  5e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  67.48 
 
 		 163 aa  226  9e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  69.38 
 
 		 157 aa  221  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  62.43 
 
 		 166 aa  214  5e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  63.01 
 
 		 171 aa  212  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  62.39 
 
 		 186 aa  147  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  47.53 
 
 		 157 aa  147  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  49.66 
 
 		 176 aa  146  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  45.22 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  50 
 
 		 143 aa  144  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 161 aa  143  9e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  59.63 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  61.9 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  47.02 
 
 		 164 aa  140  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  60 
 
 		 155 aa  140  9e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  45.16 
 
 		 164 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  55.17 
 
 		 175 aa  138  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  59.05 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  47.74 
 
 		 146 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  48.05 
 
 		 148 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  59.63 
 
 		 166 aa  137  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  57.55 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  57.55 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  45.12 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  44.65 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  48.48 
 
 		 201 aa  135  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  44.65 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  55.14 
 
 		 196 aa  134  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  42.31 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  42.58 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  50 
 
 		 222 aa  134  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  57.14 
 
 		 146 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  43.2 
 
 		 168 aa  133  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  52.94 
 
 		 238 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  56.14 
 
 		 192 aa  133  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  51.16 
 
 		 231 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  52.94 
 
 		 236 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  40.35 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  54.95 
 
 		 234 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  56.03 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  52.94 
 
 		 234 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  52.94 
 
 		 236 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  56.88 
 
 		 163 aa  131  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  48.7 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  52.94 
 
 		 234 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  52.78 
 
 		 220 aa  131  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  52.94 
 
 		 234 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  57.27 
 
 		 154 aa  132  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  42.11 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  56.88 
 
 		 152 aa  130  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  50 
 
 		 200 aa  130  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  52.78 
 
 		 242 aa  130  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  41.01 
 
 		 177 aa  130  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  50.46 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  54.21 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  55.05 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  56.19 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  41.25 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  40.78 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  50.79 
 
 		 167 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  52.25 
 
 		 236 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  38.98 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  52.78 
 
 		 231 aa  128  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  57.27 
 
 		 184 aa  128  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  50 
 
 		 178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  50 
 
 		 178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  40.57 
 
 		 171 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  50.94 
 
 		 164 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  51.85 
 
 		 225 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  50 
 
 		 178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  42.58 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  47.69 
 
 		 190 aa  127  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  41.25 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  50.81 
 
 		 188 aa  127  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  52.25 
 
 		 236 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  52.25 
 
 		 235 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  44.52 
 
 		 151 aa  126  9.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  40.57 
 
 		 175 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  51.24 
 
 		 178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  57.41 
 
 		 185 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  42.35 
 
 		 182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  55.24 
 
 		 143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  48.08 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  53.7 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  53.85 
 
 		 180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  42.42 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  42.5 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0002  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 175 aa  124  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  43.38 
 
 		 139 aa  122  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1694  single-stranded DNA-binding protein  39.24 
 
 		 148 aa  123  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  53.04 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  53.04 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>