15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2548 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2548  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  220  4.9999999999999996e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1626  hypothetical protein  71.3 
 
 
108 aa  166  8e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2275  hypothetical protein  75 
 
 
108 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0286  hypothetical protein  72.9 
 
 
108 aa  163  9e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2121  hypothetical protein  80.19 
 
 
109 aa  150  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2173  hypothetical protein  59.13 
 
 
115 aa  140  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1940  hypothetical protein  60.87 
 
 
115 aa  138  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0007  hypothetical protein  43.18 
 
 
116 aa  44.3  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6329  hypothetical protein  29.07 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0479  hypothetical protein  37.33 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.100545 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1885  hypothetical protein  41.67 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1315  hypothetical protein  32.67 
 
 
110 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1343  hypothetical protein  32.67 
 
 
110 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.914236  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4925  hypothetical protein  26.14 
 
 
100 aa  41.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0438  hypothetical protein  40.38 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>