More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2485 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
387 aa  801    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  68.88 
 
 
376 aa  558  1e-158  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  70.26 
 
 
390 aa  559  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  68.25 
 
 
381 aa  553  1e-156  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  67.92 
 
 
372 aa  534  1e-150  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  57.37 
 
 
379 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  57.26 
 
 
378 aa  459  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  36.54 
 
 
416 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.18 
 
 
380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
380 aa  233  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.56 
 
 
380 aa  233  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  32.36 
 
 
381 aa  233  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
380 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.91 
 
 
380 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.91 
 
 
380 aa  230  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  31.91 
 
 
380 aa  230  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.38 
 
 
380 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.12 
 
 
380 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
383 aa  223  6e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  32.63 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 
403 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 
393 aa  209  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  30.03 
 
 
382 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
377 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  29.53 
 
 
382 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  29.53 
 
 
382 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1095  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
383 aa  202  9e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 
378 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  31.44 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  30.67 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 
385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 
375 aa  199  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.11 
 
 
403 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  32.45 
 
 
406 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
385 aa  199  7e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
377 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
377 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10567  mannosyltransferase pimB  32.52 
 
 
378 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.711868  normal  0.156574 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  29.46 
 
 
382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 
377 aa  197  4.0000000000000005e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 
416 aa  196  6e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2544  glycosyl transferase, group 1  31.73 
 
 
401 aa  196  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.434322  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 
381 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
396 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  31.03 
 
 
406 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  32.81 
 
 
377 aa  192  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.05 
 
 
396 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  31.97 
 
 
403 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  29.26 
 
 
385 aa  192  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
375 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  30.87 
 
 
406 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  30.69 
 
 
377 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
377 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 
387 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
427 aa  189  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 
381 aa  189  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
385 aa  189  9e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3802  glycosyl transferase, group 1  36.14 
 
 
394 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.769025  normal  0.0224743 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  33.66 
 
 
413 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
376 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  32.5 
 
 
377 aa  186  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
384 aa  186  9e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
396 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
434 aa  185  9e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  28.65 
 
 
381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  32.19 
 
 
377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 
819 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 
400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 
404 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 
374 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  30.96 
 
 
406 aa  182  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
655 aa  180  4e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0755  glycosyl transferase, group 1  31.21 
 
 
375 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  31.33 
 
 
373 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3236  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
393 aa  176  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0761  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 
376 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0775  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 
376 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193821  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  33.93 
 
 
812 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2309  glycosyl transferase, group 1  31.59 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2187  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0604226  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
426 aa  170  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04450  glycosyltransferase  26.92 
 
 
405 aa  170  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 
390 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 
390 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
405 aa  169  7e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 
772 aa  169  9e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
381 aa  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5598  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 
344 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1007  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
344 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204668  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3237  putative glycosyltransferase  31.58 
 
 
343 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 
432 aa  166  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  31.66 
 
 
373 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42467  predicted protein  31.22 
 
 
679 aa  166  8e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.486955  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
385 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
387 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0904  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
372 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 
406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>