More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2445 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2445  NmrA family protein  100 
 
 		 292 aa  600  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0384  hypothetical protein  82.23 
 
 		 291 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.04 
 
 		 290 aa  343  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.470267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1312  NmrA family protein  47.02 
 
 		 295 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  49.12 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  47.22 
 
 		 305 aa  289  4e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  47.35 
 
 		 294 aa  286  2e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  47.02 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  45.96 
 
 		 297 aa  279  3e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  46.67 
 
 		 293 aa  280  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1407  NmrA family protein  42.36 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226857 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.85 
 
 		 293 aa  192  8e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  31.62 
 
 		 321 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  30.35 
 
 		 291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1077  hypothetical protein  38.41 
 
 		 146 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.158913  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.58 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  27.56 
 
 		 291 aa  106  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  27.8 
 
 		 343 aa  98.6  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000104302  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  27.01 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 308 aa  95.9  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27566  predicted protein  29.81 
 
 		 381 aa  94  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298942  normal  0.129514 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  26.52 
 
 		 357 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.84 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  26.69 
 
 		 340 aa  89.7  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  26.6 
 
 		 341 aa  87.8  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  25.51 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1059  hypothetical protein  28.57 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000180564  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0035  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putativ  26.43 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.85 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2820  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.8 
 
 		 329 aa  79  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0203208  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.46 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.36 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.79 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1613  hypothetical protein  27.01 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.899214  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  26.27 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  29.72 
 
 		 512 aa  75.9  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.58 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  24.28 
 
 		 323 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.26 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  24.28 
 
 		 323 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1374  hypothetical protein  27.95 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.920044  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0063  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase,-like protein  26.23 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_30690  predicted protein  27.69 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0211111  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.94 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.31 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2240  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  27.71 
 
 		 381 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167528  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  31.9 
 
 		 216 aa  72  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.95 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.73 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  29.63 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  27.1 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.04 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  29.14 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1353  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25.2 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.78 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1691  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  27.49 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0053937  hitchhiker  0.000000612217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0224  hypothetical protein  26.42 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.362913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  27.11 
 
 		 325 aa  68.9  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.58 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.78 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2842  hypothetical protein  27.31 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  26.47 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.15 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0046  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  25.81 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  21.79 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3590  ubiquinone dependent NADH dehydrogenase  24.28 
 
 		 327 aa  67  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.85 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.31 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 		 270 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.2 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.922509  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2127  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11128  cholesterol dehydrogenase  33.86 
 
 		 370 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2604  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.89 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  26.98 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.71 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.3 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0437  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.98 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3565  NmrA family protein  27.94 
 
 		 498 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.803676 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.66 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.14 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  28.99 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  25.21 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.8 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  30 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13181  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  21.58 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.974044  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  25.1 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.11 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.76 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>