70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2426 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  523  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  53.33 
 
 		 193 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  40.09 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  45.81 
 
 		 196 aa  169  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  43.89 
 
 		 185 aa  164  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  44.79 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  45.64 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  45.99 
 
 		 197 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  41.08 
 
 		 174 aa  148  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  42.37 
 
 		 163 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  42.37 
 
 		 163 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  45.9 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  41.24 
 
 		 203 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  45.81 
 
 		 223 aa  143  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  40.68 
 
 		 203 aa  142  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  40.22 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  40.41 
 
 		 197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  41.21 
 
 		 200 aa  140  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  46.03 
 
 		 220 aa  138  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  37.96 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  40.33 
 
 		 179 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  37.98 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  39.36 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  39.09 
 
 		 198 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  36.96 
 
 		 193 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  36.04 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  36.67 
 
 		 197 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  37.37 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  38.92 
 
 		 187 aa  125  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  38.07 
 
 		 199 aa  125  5e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  38.12 
 
 		 177 aa  123  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  36.28 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  34.39 
 
 		 251 aa  119  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  34.92 
 
 		 198 aa  118  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  39.34 
 
 		 207 aa  118  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1437  hypothetical protein  35.71 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1529  hypothetical protein  34.41 
 
 		 192 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  36.36 
 
 		 190 aa  99.4  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0779  hypothetical protein  51.22 
 
 		 107 aa  97.1  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  29.29 
 
 		 258 aa  95.1  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0555  hypothetical protein  41.3 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4519  hypothetical protein  46.67 
 
 		 152 aa  67.8  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  27.16 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  28.57 
 
 		 176 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2775  hypothetical protein  36.05 
 
 		 129 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.963752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  28.05 
 
 		 179 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  29.06 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  28.48 
 
 		 176 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  22.36 
 
 		 191 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  24.55 
 
 		 178 aa  49.3  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  26.61 
 
 		 1345 aa  48.9  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  26.61 
 
 		 1372 aa  48.9  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1351  hypothetical protein  34.25 
 
 		 165 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0430442  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  25 
 
 		 153 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1352  hypothetical protein  37.1 
 
 		 172 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0376314  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  23.49 
 
 		 178 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  26.99 
 
 		 177 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  28.57 
 
 		 214 aa  45.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  23.46 
 
 		 179 aa  45.8  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  28.57 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  23.12 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  26.99 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  30 
 
 		 178 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  23.64 
 
 		 177 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  22.73 
 
 		 161 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  23.85 
 
 		 164 aa  43.1  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  25.93 
 
 		 175 aa  42.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  22.5 
 
 		 149 aa  42.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  21.88 
 
 		 153 aa  42  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  25 
 
 		 187 aa  42  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>