More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2355 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 149 aa  310  5.999999999999999e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  84.56 
 
 		 151 aa  279  1e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  85.91 
 
 		 149 aa  276  8e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  85.23 
 
 		 149 aa  273  6e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  82.55 
 
 		 149 aa  272  1.0000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  79.87 
 
 		 149 aa  264  2.9999999999999995e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  78.52 
 
 		 150 aa  262  8.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  63.64 
 
 		 147 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 		 145 aa  191  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  62.77 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  190  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 		 142 aa  190  7e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 		 142 aa  190  7e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  189  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  63.24 
 
 		 170 aa  189  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  59.56 
 
 		 148 aa  189  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  60.84 
 
 		 149 aa  187  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 147 aa  187  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 147 aa  187  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 147 aa  186  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 146 aa  186  8e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 147 aa  186  9e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  185  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 147 aa  186  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 145 aa  186  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  62.96 
 
 		 143 aa  184  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  59.4 
 
 		 150 aa  185  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0350  50S ribosomal protein L13  60.9 
 
 		 150 aa  185  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.861215 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  58.9 
 
 		 151 aa  184  3e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 147 aa  184  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  59.12 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  60.43 
 
 		 143 aa  183  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  62.22 
 
 		 143 aa  183  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  57.66 
 
 		 148 aa  183  8e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  183  9e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  61.48 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  56.25 
 
 		 148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  59.12 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  62.04 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  60.9 
 
 		 151 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 147 aa  181  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  60.58 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 151 aa  180  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  180  6e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 151 aa  180  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 144 aa  180  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  180  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  57.78 
 
 		 144 aa  180  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  58.65 
 
 		 150 aa  180  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  59.12 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 147 aa  179  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2586  50S ribosomal protein L13  60.69 
 
 		 151 aa  179  8.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 146 aa  179  9.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  58.39 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  58.52 
 
 		 145 aa  179  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  58.39 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  61.31 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  59.12 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 144 aa  179  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  61.03 
 
 		 151 aa  179  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 143 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 142 aa  179  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  59.12 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  59.12 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 147 aa  178  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  59.26 
 
 		 150 aa  177  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  59.12 
 
 		 142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  60.58 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  59.12 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0880  ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 147 aa  177  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>