33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2313 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  100 
 
 		 331 aa  673    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  68.88 
 
 		 331 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1948  DsrM protein  68.48 
 
 		 332 aa  484  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.542498  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  67.37 
 
 		 331 aa  483  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  64.95 
 
 		 331 aa  479  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  66.47 
 
 		 331 aa  474  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  65.86 
 
 		 331 aa  461  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  50.9 
 
 		 333 aa  352  4e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  51.76 
 
 		 330 aa  345  7e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  52.79 
 
 		 332 aa  338  5e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  49.7 
 
 		 330 aa  338  5.9999999999999996e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000153702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  50 
 
 		 335 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  50.16 
 
 		 337 aa  323  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  48.32 
 
 		 334 aa  322  5e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  48.76 
 
 		 334 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0450  nitrate reductase gamma subunit  46.99 
 
 		 342 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00150566  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0451  Nitrate reductase gamma subunit  49.31 
 
 		 339 aa  268  7e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  33.96 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1659  nitrate reductase, gamma subunit  31.47 
 
 		 255 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2479  putative DsrM protein  31.14 
 
 		 244 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2191  Nitrate reductase gamma subunit  33.82 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1957  nitrate reductase, gamma subunit  29.82 
 
 		 248 aa  100  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  32.58 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  32.02 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1535  nitrate reductase, gamma subunit  27.34 
 
 		 262 aa  57  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  28.28 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0033  Nitrate reductase gamma subunit  25.26 
 
 		 254 aa  53.1  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0248  Nitrate reductase gamma subunit  24.35 
 
 		 299 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0906  nitrate reductase, gamma subunit  30.18 
 
 		 257 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0075  Nitrate reductase gamma subunit  25.78 
 
 		 289 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  26.14 
 
 		 261 aa  47.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2192  hypothetical protein  26.15 
 
 		 255 aa  47.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2125  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.83 
 
 		 254 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>