More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2281 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
337 aa  686    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  69.49 
 
 
332 aa  478  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  73.52 
 
 
323 aa  473  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  72.39 
 
 
331 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  66.15 
 
 
328 aa  432  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  64.44 
 
 
325 aa  421  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  62.58 
 
 
331 aa  402  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  51.17 
 
 
319 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3181  glycosyl transferase family 2  46.77 
 
 
318 aa  315  7e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  46.78 
 
 
331 aa  311  7.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  45.96 
 
 
314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  45.03 
 
 
315 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.08 
 
 
317 aa  301  1e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5120  glycosyl transferase family 2  45.71 
 
 
323 aa  299  5e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1792  b-glycosyltransferase  44.58 
 
 
324 aa  281  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.794906 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  41.74 
 
 
319 aa  281  1e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11238  putative glycosyltransferase  41.98 
 
 
317 aa  277  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  45.15 
 
 
320 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  42.63 
 
 
320 aa  276  4e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  42.94 
 
 
318 aa  276  5e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  42.95 
 
 
321 aa  276  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  42.41 
 
 
312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  44.82 
 
 
320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  43.75 
 
 
313 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  43.26 
 
 
342 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  44.22 
 
 
318 aa  271  8.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  42.5 
 
 
320 aa  268  8.999999999999999e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  44.65 
 
 
329 aa  265  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  45.6 
 
 
337 aa  263  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  43.29 
 
 
320 aa  262  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  40.88 
 
 
336 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  41.95 
 
 
320 aa  258  7e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  39.06 
 
 
324 aa  256  3e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  40.94 
 
 
320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  42.45 
 
 
337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  41 
 
 
314 aa  249  4e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  39.2 
 
 
324 aa  248  7e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  37.57 
 
 
343 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  40.63 
 
 
324 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0656  glycosyl transferase family protein  40.62 
 
 
329 aa  246  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  39.87 
 
 
343 aa  245  9e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.56 
 
 
320 aa  243  5e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  40.56 
 
 
320 aa  243  5e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4415  glycosyl transferase family protein  43.4 
 
 
339 aa  242  7e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  41.25 
 
 
335 aa  241  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2585  glycosyl transferase family protein  39.94 
 
 
316 aa  239  5e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0445  glycosyl transferase family 2  38.44 
 
 
334 aa  238  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  39.51 
 
 
368 aa  237  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  40.87 
 
 
336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  40.87 
 
 
336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  36.25 
 
 
314 aa  235  8e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  36.25 
 
 
314 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  38.32 
 
 
314 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  37.73 
 
 
313 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  39.53 
 
 
310 aa  231  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0760  glycosyl transferase family protein  43.71 
 
 
343 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.057751 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2286  glycosyl transferase family protein  38.93 
 
 
325 aa  229  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.398997  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0955  glycosyl transferase family 2  37.96 
 
 
338 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254585  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1106  glycosyl transferase family 2  38.84 
 
 
338 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263485  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  41.64 
 
 
358 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  39.53 
 
 
312 aa  228  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.32 
 
 
316 aa  226  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  38.01 
 
 
329 aa  225  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  35.82 
 
 
341 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  38.12 
 
 
318 aa  223  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  38.01 
 
 
310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  38.12 
 
 
310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  39.53 
 
 
310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 
344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  44.72 
 
 
568 aa  219  6e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1772  putative glycosyltransferase transmembrane protein  35.38 
 
 
347 aa  218  7.999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.437602  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3622  glycosyl transferase family protein  39.67 
 
 
398 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00095064 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  37.31 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2203  glycosyl transferase family 2  38.61 
 
 
315 aa  211  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1411  glycosyltransferase transmembrane protein  40.21 
 
 
302 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1174  glycosyl transferase family protein  41.77 
 
 
240 aa  192  7e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3770  b-glycosyltransferase  31.6 
 
 
331 aa  179  7e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0756  glycosyl transferase family 2  40.85 
 
 
242 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.62 
 
 
240 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2553  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.48 
 
 
237 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  37.66 
 
 
243 aa  173  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2078  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.67 
 
 
327 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  32.12 
 
 
322 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  32.12 
 
 
322 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.12 
 
 
322 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  40.34 
 
 
234 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.12 
 
 
322 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  32.12 
 
 
322 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.12 
 
 
322 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  38.14 
 
 
249 aa  171  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1271  glycosyltransferase  38.14 
 
 
237 aa  170  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 
310 aa  169  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.12 
 
 
322 aa  169  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.79 
 
 
322 aa  169  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0280  glycosyl transferase family 2  31.44 
 
 
312 aa  169  6e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.01 
 
 
327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.33 
 
 
326 aa  165  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.68 
 
 
327 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.68 
 
 
327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>