255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2280 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 223 aa  462  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  70.64 
 
 		 223 aa  313  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  65.3 
 
 		 220 aa  303  1.0000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  62.39 
 
 		 226 aa  299  2e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  59.64 
 
 		 223 aa  263  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  57.27 
 
 		 223 aa  249  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  54.79 
 
 		 222 aa  238  6.999999999999999e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  49.09 
 
 		 215 aa  201  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  43.26 
 
 		 213 aa  181  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  43.26 
 
 		 213 aa  181  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  43.87 
 
 		 233 aa  178  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  47.42 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  44.81 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  47.42 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  43.6 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  44.86 
 
 		 215 aa  175  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  44.91 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  42.86 
 
 		 216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  41.59 
 
 		 234 aa  172  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  43.93 
 
 		 264 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  41.59 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  41.12 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  42.92 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  43.38 
 
 		 223 aa  168  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  40.57 
 
 		 217 aa  168  7e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  43.72 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  40.76 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  41.12 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  41.98 
 
 		 213 aa  165  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  42.06 
 
 		 226 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  41.98 
 
 		 217 aa  165  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  39.25 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  41.51 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  39.25 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  45.37 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  43.6 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  38.79 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  38.79 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  42.59 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  39.38 
 
 		 245 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  41.12 
 
 		 193 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 232 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  38.64 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  39.47 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  39.38 
 
 		 244 aa  148  7e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  38.01 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  38.03 
 
 		 226 aa  145  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  37.61 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  35.78 
 
 		 210 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  35.32 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  34.4 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  33.94 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  35.05 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  33.18 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  34.45 
 
 		 202 aa  102  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  32.86 
 
 		 202 aa  95.5  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  32.23 
 
 		 202 aa  93.2  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  30.51 
 
 		 253 aa  92.4  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  34.91 
 
 		 202 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  33.48 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  38.74 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  29.55 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  31.67 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  32.97 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  30.8 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  28.44 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  37.39 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  35.5 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  35.51 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  31.33 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3495  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  31.43 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  33.98 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6259  Radical SAM domain protein  29.67 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  31.76 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4051  radical SAM family protein  31.22 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  31.25 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  31.76 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  32.71 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  29.15 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  33.01 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  26.6 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  26.43 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  26.85 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  32.56 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  33.15 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  27.85 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  29.58 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  28.45 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  26.42 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  28.05 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0222  radical SAM domain-containing protein  27.43 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  28.11 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18221  putative organic radical activating protein  27.35 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  32.67 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  41.1 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  25.61 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  38.1 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  30.83 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  24.17 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>