More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2250 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2250  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 
282 aa  553  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.246331  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  71.28 
 
 
282 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1692  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  71.17 
 
 
282 aa  400  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1735  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  71.43 
 
 
283 aa  398  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  70.46 
 
 
282 aa  391  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  73.86 
 
 
282 aa  389  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0665  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  66.67 
 
 
282 aa  378  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2660  undecaprenol kinase  47.54 
 
 
277 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20010  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.1 
 
 
286 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122239 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2797  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.43 
 
 
292 aa  231  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0789  Undecaprenyl-diphosphatase  43.73 
 
 
279 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.04 
 
 
292 aa  227  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155916  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4500  undecaprenol kinase  43.97 
 
 
386 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3522  undecaprenol kinase  45.83 
 
 
274 aa  226  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09180  Undecaprenyl-diphosphatase  45.55 
 
 
281 aa  224  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.352379  normal  0.402204 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1937  undecaprenol kinase  47.69 
 
 
272 aa  223  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.07864  normal  0.489948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2133  undecaprenol kinase  43.55 
 
 
281 aa  221  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4191  undecaprenol kinase  45.77 
 
 
320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195911 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2167  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.08 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00790926  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2623  undecaprenyl-diphosphatase  44.56 
 
 
274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2318  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.67 
 
 
278 aa  219  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2164  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.04 
 
 
278 aa  218  7e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0646427  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16250  Undecaprenyl-diphosphatase  44.04 
 
 
290 aa  218  7.999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0295918  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1910  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.45 
 
 
277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014335 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12166  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.58 
 
 
276 aa  212  7e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.490022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0633  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.91 
 
 
320 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.395478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0102  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.03 
 
 
278 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0163  putative undecaprenol kinase  42.76 
 
 
304 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.714151  normal  0.0225352 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3232  undecaprenol kinase  46.32 
 
 
322 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.14463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2864  undecaprenol kinase  46.32 
 
 
322 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3043  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.14 
 
 
276 aa  208  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11800  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.94 
 
 
277 aa  207  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2282  undecaprenol kinase  44.13 
 
 
273 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000232331  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3596  undecaprenol kinase  43.66 
 
 
272 aa  205  9e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.557046  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1194  undecaprenol kinase  44.9 
 
 
289 aa  204  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0743133  normal  0.0386066 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4459  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.81 
 
 
278 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.806671  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20990  Undecaprenyl-diphosphatase  45.22 
 
 
285 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4503  undecaprenol kinase  42.46 
 
 
278 aa  202  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978161  decreased coverage  0.00384903 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2438  undecaprenol kinase  42.46 
 
 
280 aa  201  8e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5676  undecaprenol kinase  42.25 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.229303  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3220  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.11 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3170  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.11 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3158  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.11 
 
 
282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.86 
 
 
288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.39732  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1818  putative undecaprenol kinase  46.04 
 
 
281 aa  199  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2249  undecaprenol kinase  42.81 
 
 
290 aa  198  7.999999999999999e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221802  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3483  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.14 
 
 
276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0662586  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4798  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.83 
 
 
312 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0638126  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1039  undecaprenol kinase  40.82 
 
 
279 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0725  putative undecaprenol kinase  42.01 
 
 
281 aa  193  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60596  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2011  undecaprenol kinase  44.2 
 
 
300 aa  192  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001615  undecaprenyl-diphosphatase  41.18 
 
 
267 aa  188  9e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.754191  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00857  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.18 
 
 
267 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02211  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.39 
 
 
293 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0358  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.79 
 
 
283 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0330  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.52 
 
 
266 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2775  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.75 
 
 
280 aa  185  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000224739  hitchhiker  0.000207521 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0835  putative undecaprenol kinase  38.83 
 
 
261 aa  185  8e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1478  undecaprenol kinase  41.39 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310776  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0054  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.5 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.849769  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3133  undecaprenyl-diphosphatase  41.01 
 
 
269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000445999  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0157  undecaprenyl-diphosphatase  44.52 
 
 
292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.214752  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3583  putative undecaprenol kinase  39.15 
 
 
273 aa  183  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2469  undecaprenyl-diphosphatase  36.05 
 
 
339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0199195  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0571  undecaprenyl-diphosphatase  38.43 
 
 
261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920571  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0164  Undecaprenyl-diphosphatase  43.46 
 
 
292 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.86 
 
 
272 aa  180  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1289  undecaprenyl-diphosphatase  42.12 
 
 
258 aa  178  8e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2690  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.27 
 
 
267 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1834  Bacitracin resistance protein BacA  39.19 
 
 
265 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3860  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.57 
 
 
278 aa  176  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0340187  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3641  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.55 
 
 
265 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.13 
 
 
287 aa  176  5e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.684943  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4137  putative undecaprenol kinase  40.58 
 
 
270 aa  175  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.383043  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1209  undecaprenol kinase  38.11 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3115  undecaprenol kinase  36.73 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1004  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.29 
 
 
266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218186  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1845  undecaprenol kinase  39.49 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03448  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.63 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.71 
 
 
266 aa  172  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277611  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.18 
 
 
266 aa  172  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0258083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0387  undecaprenol kinase, putative  40.43 
 
 
269 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06831  bacitracin resistance protein BacA  37.41 
 
 
291 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.834409 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0282  Undecaprenyl-diphosphatase  42.6 
 
 
291 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160611 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0766  undecaprenyl-diphosphatase  38.03 
 
 
276 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.935106  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0175  Undecaprenyl-diphosphatase  43.46 
 
 
292 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0335  undecaprenol kinase  39.71 
 
 
291 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.395953  normal  0.197846 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0831  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.64 
 
 
266 aa  169  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1112  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.6 
 
 
266 aa  169  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511751  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0067  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36 
 
 
264 aa  169  7e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0252  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.73 
 
 
279 aa  168  9e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0294819  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3383  putative undecaprenol kinase  38.27 
 
 
290 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1258  putative undecaprenol kinase  40.45 
 
 
266 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.53 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507346  normal  0.0186967 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1046  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.85 
 
 
266 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.403088  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1734  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.96 
 
 
264 aa  166  4e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00685278  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09201  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36 
 
 
279 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0131837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1196  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.87 
 
 
266 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.38552  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1080  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.92 
 
 
266 aa  166  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.025115  normal  0.0318175 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1229  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.87 
 
 
266 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188967  normal  0.828376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>