151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2237 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2237  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 457 aa  950    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0110265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  39.58 
 
 		 1150 aa  83.2  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0463  hypothetical protein  32.34 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.679591  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  30.52 
 
 		 258 aa  65.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4610  GUN4 domain protein  34.62 
 
 		 684 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  28.47 
 
 		 2216 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  39.74 
 
 		 1427 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0585  hypothetical protein  34.41 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0677  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 233 aa  58.9  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2856  methyltransferase type 12  35.83 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0897  hypothetical protein  25.83 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6797  hypothetical protein  35.79 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126734  normal  0.776248 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4376  hypothetical protein  32.65 
 
 		 447 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000112995 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0859  hypothetical protein  29.84 
 
 		 593 aa  56.2  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.837601  normal  0.245097 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1181  methyltransferase type 12  34.19 
 
 		 268 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  33.33 
 
 		 559 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4772  hypothetical protein  26.71 
 
 		 346 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4471  methyltransferase type 11  25.22 
 
 		 214 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00423193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  23.89 
 
 		 209 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.69 
 
 		 1044 aa  54.7  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  23.42 
 
 		 250 aa  54.3  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  24.22 
 
 		 663 aa  54.7  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 572 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1812  hypothetical protein  31.3 
 
 		 334 aa  53.9  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881235  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17011  glycine-sarcosine methyltransferase  33.06 
 
 		 283 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 251 aa  53.9  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 637 aa  53.5  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2749  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 252 aa  53.5  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 262 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  23.02 
 
 		 190 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  25.62 
 
 		 280 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 244 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  29.94 
 
 		 247 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  28.83 
 
 		 296 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 276 aa  51.6  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5422  hypothetical protein  30.32 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000729862  normal  0.0261161 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1279  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.32 
 
 		 253 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  28.1 
 
 		 269 aa  51.2  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4859  hypothetical protein  26.27 
 
 		 254 aa  50.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.069885 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  22.4 
 
 		 259 aa  50.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.03 
 
 		 155 aa  50.4  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  22.79 
 
 		 195 aa  50.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  28.21 
 
 		 522 aa  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1678  methyltransferase type 12  32.48 
 
 		 268 aa  50.1  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0186038  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  28.21 
 
 		 526 aa  50.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  29.55 
 
 		 244 aa  49.7  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6748  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 267 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6192  Methyltransferase type 11  26.35 
 
 		 254 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00325  hypothetical protein  32.26 
 
 		 353 aa  49.3  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.280662  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  23.02 
 
 		 190 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 286 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  25.29 
 
 		 258 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2863  hypothetical protein  30.7 
 
 		 254 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276445 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 246 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0179  Methyltransferase type 12  31.09 
 
 		 272 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  23.16 
 
 		 262 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  24.56 
 
 		 249 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2585  methyltransferase  29.92 
 
 		 254 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  28.57 
 
 		 246 aa  48.5  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0127  methyltransferase type 12  30.82 
 
 		 251 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  25.41 
 
 		 251 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  26.27 
 
 		 257 aa  47.8  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  24.56 
 
 		 249 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  28.23 
 
 		 256 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  28.39 
 
 		 253 aa  47.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2616  methyltransferase  29.82 
 
 		 254 aa  47.4  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183675  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  24.56 
 
 		 249 aa  47  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  23.98 
 
 		 249 aa  47  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2664  hypothetical protein  29.82 
 
 		 254 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  24.56 
 
 		 249 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  24.56 
 
 		 249 aa  47  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  24.56 
 
 		 249 aa  47  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0559  hypothetical protein  27.73 
 
 		 252 aa  47  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2858  hypothetical protein  29.82 
 
 		 254 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  24.56 
 
 		 249 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  24.56 
 
 		 249 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2906  hypothetical protein  29.82 
 
 		 254 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  24.38 
 
 		 246 aa  47  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0873  hypothetical protein  31.87 
 
 		 362 aa  47  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000116337  hitchhiker  0.00593532 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2601  putative signal transduction protein with NACHT domain  35.37 
 
 		 100 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  28.23 
 
 		 256 aa  47  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.69 
 
 		 299 aa  46.6  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  25.31 
 
 		 251 aa  46.6  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  24.56 
 
 		 249 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 199 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1113  bifunctional 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase and 2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  25.16 
 
 		 241 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1254  methyltransferase type 12  28.45 
 
 		 226 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.452774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4911  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  24.83 
 
 		 270 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.168902 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  22.73 
 
 		 202 aa  46.6  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 277 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.75 
 
 		 229 aa  45.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  21.8 
 
 		 337 aa  45.8  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  27.06 
 
 		 266 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2422  methyltransferase  29.82 
 
 		 253 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.440129 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1515  methyltransferase domain-containing protein  28.95 
 
 		 200 aa  45.8  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  23.98 
 
 		 249 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  25.48 
 
 		 265 aa  45.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  24.78 
 
 		 286 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1427  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.21 
 
 		 240 aa  45.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000505917  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  26.74 
 
 		 201 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.511767 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>