More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2192 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  46.51 
 
 		 1201 aa  779    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  59.16 
 
 		 1044 aa  998    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  51.42 
 
 		 960 aa  793    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  56.24 
 
 		 923 aa  947    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  50.4 
 
 		 1044 aa  783    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  45.19 
 
 		 1053 aa  887    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  63.7 
 
 		 1007 aa  1302    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  66.28 
 
 		 1041 aa  1135    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  65.72 
 
 		 1023 aa  1384    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  53.7 
 
 		 1183 aa  871    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  46.12 
 
 		 1190 aa  677    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 1049 aa  2178    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  48.35 
 
 		 1186 aa  751    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  47.28 
 
 		 1064 aa  875    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  51.67 
 
 		 1049 aa  989    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  46.4 
 
 		 965 aa  707    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  56.84 
 
 		 1492 aa  947    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  52.36 
 
 		 1581 aa  865    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  34.81 
 
 		 1200 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  49.08 
 
 		 775 aa  225  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1598  hypothetical protein  32.34 
 
 		 644 aa  219  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1037  hypothetical protein  47.43 
 
 		 174 aa  157  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  30.47 
 
 		 1818 aa  132  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.13 
 
 		 908 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.24 
 
 		 997 aa  127  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  42.07 
 
 		 251 aa  121  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  23.53 
 
 		 949 aa  117  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  35.63 
 
 		 273 aa  116  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2655  hypothetical protein  35.23 
 
 		 278 aa  115  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0589168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  24.46 
 
 		 953 aa  115  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.05 
 
 		 1067 aa  113  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  33.89 
 
 		 1080 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1556  hypothetical protein  47.18 
 
 		 263 aa  111  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808052  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  23.71 
 
 		 957 aa  110  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  40 
 
 		 263 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  30.39 
 
 		 614 aa  109  3e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  30.47 
 
 		 439 aa  107  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  30.69 
 
 		 325 aa  106  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.87 
 
 		 416 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  37.87 
 
 		 416 aa  106  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.73 
 
 		 762 aa  105  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.73 
 
 		 762 aa  105  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  38.41 
 
 		 253 aa  105  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  25.06 
 
 		 1148 aa  104  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.17 
 
 		 942 aa  104  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.86 
 
 		 1086 aa  104  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  35.5 
 
 		 417 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  30.25 
 
 		 538 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  31.76 
 
 		 751 aa  102  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  27.79 
 
 		 586 aa  101  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  29.82 
 
 		 267 aa  99.8  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.99 
 
 		 805 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  31.54 
 
 		 826 aa  99.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  29.17 
 
 		 742 aa  100  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.89 
 
 		 888 aa  99.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  24.48 
 
 		 1349 aa  99  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  25.98 
 
 		 783 aa  99.4  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  36.17 
 
 		 412 aa  98.6  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  28.75 
 
 		 433 aa  98.6  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  28.16 
 
 		 444 aa  98.2  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  34.33 
 
 		 1104 aa  98.2  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.39 
 
 		 1091 aa  97.8  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  36.47 
 
 		 433 aa  97.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  35.67 
 
 		 766 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  38.51 
 
 		 398 aa  96.7  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.98 
 
 		 554 aa  96.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  27.04 
 
 		 517 aa  95.9  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  26.81 
 
 		 818 aa  95.5  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  30.8 
 
 		 861 aa  95.1  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  25.06 
 
 		 766 aa  94.7  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.63 
 
 		 887 aa  95.1  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  33.52 
 
 		 1392 aa  94.7  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  32.04 
 
 		 446 aa  94.7  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2035  hypothetical protein  31.56 
 
 		 338 aa  94.4  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4578  hypothetical protein  34.16 
 
 		 852 aa  93.6  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.54262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  35.45 
 
 		 636 aa  93.6  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.82 
 
 		 951 aa  93.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  34.97 
 
 		 287 aa  94  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  28.92 
 
 		 586 aa  93.2  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  36.07 
 
 		 312 aa  93.2  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  27.03 
 
 		 892 aa  92.8  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  26.74 
 
 		 1216 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0125  hypothetical protein  33.33 
 
 		 781 aa  92.8  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  36.84 
 
 		 877 aa  92.4  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  24.45 
 
 		 1339 aa  92  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  34.88 
 
 		 444 aa  92  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  37.5 
 
 		 277 aa  92  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  31.55 
 
 		 819 aa  91.7  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  35.47 
 
 		 291 aa  91.3  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  27.08 
 
 		 2216 aa  91.3  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  25 
 
 		 1004 aa  91.3  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  26.32 
 
 		 862 aa  91.3  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  27.4 
 
 		 437 aa  90.9  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  30.58 
 
 		 398 aa  90.9  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  34.27 
 
 		 319 aa  90.9  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  29.96 
 
 		 829 aa  89.7  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  24.82 
 
 		 1237 aa  90.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  27.72 
 
 		 506 aa  90.1  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  29.33 
 
 		 1911 aa  90.1  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  35.63 
 
 		 446 aa  90.1  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>