11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2187 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2187    100 
 
 		 1399 bp  2773    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000234856  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  87.88 
 
 		 3150 bp  67.9  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  89.29 
 
 		 3126 bp  63.9  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  84.81 
 
 		 3150 bp  61.9  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  87.1 
 
 		 2898 bp  60  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  90 
 
 		 3606 bp  60  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  86.15 
 
 		 3162 bp  58  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  86.89 
 
 		 3024 bp  58  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  85.07 
 
 		 2772 bp  54  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  90.24 
 
 		 2883 bp  50.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  83.56 
 
 		 3072 bp  50.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>