More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2117 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2117  Methyltransferase type 11  100 
 
 
221 aa  460  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
253 aa  78.2  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  39.32 
 
 
240 aa  78.2  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  30.32 
 
 
251 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
253 aa  74.7  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.3 
 
 
236 aa  74.7  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  31.18 
 
 
269 aa  71.6  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  30.88 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  30.88 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  37.04 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  37.04 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  30.41 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  37.04 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  27.47 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  34.88 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  37.04 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  37.07 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  32.89 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  32.89 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  29.93 
 
 
243 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  38.74 
 
 
268 aa  68.2  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  37.61 
 
 
285 aa  68.2  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  37.61 
 
 
285 aa  68.2  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  37.04 
 
 
251 aa  68.2  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  30.41 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.93 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  30.41 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  29.41 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.126123  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  30.72 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  29.11 
 
 
236 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.94 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  27.08 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  32.76 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  30.97 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  32.76 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  31.97 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  32.76 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  32.76 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  28.96 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  37.84 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  31.29 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  36.89 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  32.37 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  37.5 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.84 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.37 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  37.5 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.84 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  29.45 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  37.5 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  26.76 
 
 
276 aa  65.1  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  37.5 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.75 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
269 aa  65.1  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.96 
 
 
256 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.27 
 
 
251 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
265 aa  65.1  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  35.16 
 
 
287 aa  65.1  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.27 
 
 
251 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.94 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27.36 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  31.9 
 
 
251 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  31.9 
 
 
251 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  31.9 
 
 
251 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  41.49 
 
 
255 aa  64.3  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.82 
 
 
251 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  31.9 
 
 
251 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  31.9 
 
 
251 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.18 
 
 
243 aa  64.3  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.18 
 
 
234 aa  64.7  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0867  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE, putative  32.52 
 
 
256 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.39 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 
269 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  32.39 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.88 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.39 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  36.8 
 
 
339 aa  63.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 
270 aa  63.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
244 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.39 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
244 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  39 
 
 
256 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  33.6 
 
 
283 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25.75 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  30.08 
 
 
253 aa  63.2  0.000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  30.77 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.52 
 
 
232 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1102  methyltransferase type 11  39.36 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.36 
 
 
236 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>