More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2103 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  100 
 
 
568 aa  1128  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  80.04 
 
 
568 aa  939  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1553  sulphate anion transporter  81.16 
 
 
553 aa  890  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  3.64529e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  80.99 
 
 
570 aa  948  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  72.81 
 
 
556 aa  808  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  82.39 
 
 
568 aa  955  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  51.76 
 
 
606 aa  582  1e-165  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  53.19 
 
 
545 aa  570  1e-161  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  53.78 
 
 
560 aa  556  1e-157  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1731  SulP family sulfate permease  53.69 
 
 
551 aa  558  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.281721  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1459  SulP family sulfate permease  52.79 
 
 
551 aa  547  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.032999  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  52.72 
 
 
558 aa  544  1e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0840  sulfate transporter  49.1 
 
 
559 aa  527  1e-148  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  48.28 
 
 
568 aa  522  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  51.2 
 
 
552 aa  525  1e-147  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  46.56 
 
 
570 aa  522  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1136  sulfate transporter  50.9 
 
 
572 aa  514  1e-144  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  51.74 
 
 
552 aa  514  1e-144  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1078  sulfate transporter  50.64 
 
 
552 aa  505  1e-141  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408762  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2506  sulfate permease  47.85 
 
 
581 aa  501  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037188  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0245  sulfate transporter family protein  46.22 
 
 
605 aa  487  1e-136  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.651817  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1686  sulfate transporter  50.28 
 
 
552 aa  482  1e-135  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  49.07 
 
 
567 aa  481  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  44.49 
 
 
553 aa  480  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  48.41 
 
 
567 aa  475  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2581  sulphate transporter  44.53 
 
 
563 aa  476  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  2.13177e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  47.2 
 
 
560 aa  463  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  45.26 
 
 
563 aa  458  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  45.07 
 
 
587 aa  452  1e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  44.24 
 
 
563 aa  447  1e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  45.39 
 
 
583 aa  439  1e-122  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4982  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  46.77 
 
 
552 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  45.54 
 
 
551 aa  433  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0062  sulfate permease family protein  46.28 
 
 
553 aa  429  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.18031e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24970  Sulphate transporter-SulP-type  48.26 
 
 
553 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3404  sulfate permease family protein  44.77 
 
 
587 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1643  sulphate transporter  44.23 
 
 
583 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  43.66 
 
 
572 aa  421  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  45.9 
 
 
555 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1354  sulphate transporter  44.5 
 
 
541 aa  409  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0620345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  41.04 
 
 
558 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1992  sulphate transporter  48.35 
 
 
559 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.998362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1808  sulfate transporter  45.85 
 
 
587 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2760  sulphate transporter  43.14 
 
 
607 aa  405  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.207505 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  45.37 
 
 
581 aa  404  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1668  sulphate transporter  44.92 
 
 
550 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  43.42 
 
 
564 aa  399  1e-110  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3320  putative sulfate transporter YchM  42.47 
 
 
573 aa  399  1e-110  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232868  hitchhiker  0.00197509 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  43.98 
 
 
579 aa  398  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0616  sulphate transporter  43.56 
 
 
580 aa  395  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.012784 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  41.21 
 
 
575 aa  391  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  47.26 
 
 
573 aa  386  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1108  sulphate transporter  43.96 
 
 
583 aa  389  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0960  sulphate transporter  39.25 
 
 
556 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1138  putative sulfate transporter YchM  39.53 
 
 
587 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0640  sulphate transporter  44 
 
 
581 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.029925  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1556  sulphate transporter  46.21 
 
 
568 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.902777  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3253  putative sulfate transporter YchM  39.78 
 
 
587 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0741  sulphate transporter  40.93 
 
 
586 aa  386  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1042  putative sulfate transporter YchM  40.72 
 
 
585 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1104  putative sulfate transporter YchM  39.71 
 
 
587 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1160  sulfate transporter  39.89 
 
 
554 aa  388  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175133  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1037  putative sulfate transporter YchM  39.71 
 
 
587 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  43.27 
 
 
577 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2061  putative sulfate transporter YchM  40.97 
 
 
565 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2174  putative sulfate transporter YchM  40.97 
 
 
565 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1334  putative sulfate transporter YchM  40.55 
 
 
574 aa  379  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.817877  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3470  putative sulfate transporter YchM  41.58 
 
 
578 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2454  putative sulfate transporter YchM  40.79 
 
 
565 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1995  putative sulfate transporter YchM  39.75 
 
 
562 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3553  putative sulfate transporter YchM  39.28 
 
 
588 aa  372  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2974  putative sulfate transporter YchM  40.18 
 
 
590 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.117668  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2575  putative sulfate transporter YchM  40.61 
 
 
567 aa  371  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3154  putative sulfate transporter YchM  40 
 
 
590 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.32723  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3056  putative sulfate transporter YchM  40 
 
 
590 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2268  putative sulfate transporter YchM  40.61 
 
 
572 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2233  sulphate transporter  43.34 
 
 
545 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.566684  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1792  sulfate transporter  38.85 
 
 
571 aa  361  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0580  SulP family sulfate transporter  44.86 
 
 
632 aa  361  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0511  sulphate transporter  43.15 
 
 
544 aa  357  3e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0886491 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3674  putative sulfate transporter YchM  39.09 
 
 
575 aa  356  7e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1540  putative sulfate transporter YchM  39.49 
 
 
561 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0985805  normal  0.161381 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1356  putative sulfate transporter YchM  39.31 
 
 
561 aa  354  3e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0275368  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5173  sulphate transporter  46.59 
 
 
426 aa  353  4e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00867302  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1978  putative sulfate transporter YchM  39.13 
 
 
561 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846232  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1920  putative sulfate transporter YchM  38.95 
 
 
561 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0235525  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0497  putative sulfate transporter YchM  40.73 
 
 
565 aa  351  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1914  putative sulfate transporter YchM  38.95 
 
 
561 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.200297  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1426  putative sulfate transporter YchM  37.43 
 
 
579 aa  351  2e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.144333  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2342  putative sulfate transporter YchM  38.22 
 
 
560 aa  350  4e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1353  putative sulfate transporter YchM  39.13 
 
 
550 aa  343  4e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000101083  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1936  putative sulfate transporter YchM  39.13 
 
 
559 aa  343  4e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.6191e-05  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1687  putative sulfate transporter YchM  39.13 
 
 
559 aa  343  4e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000554758  normal  0.520634 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1311  putative sulfate transporter YchM  39.13 
 
 
550 aa  343  4e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.28855e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01181  predicted transporter  39.13 
 
 
559 aa  343  4e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.968457  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2441  sulfate transporter  39.13 
 
 
550 aa  343  4e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2420  putative sulfate transporter YchM  39.13 
 
 
550 aa  343  4e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.643639  hitchhiker  0.00551985 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01191  hypothetical protein  39.13 
 
 
559 aa  343  4e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.818983  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0608  putative sulfate transporter YchM  40.84 
 
 
594 aa  339  8e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.288861  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0965  putative sulfate transporter YchM  38.89 
 
 
573 aa  336  7e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.175193  normal  0.1395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>