11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2084 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2084  hypothetical protein  100 
 
 		 59 aa  116  7.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000115145  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0710  hypothetical protein  59.26 
 
 		 80 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1821  hypothetical protein  45.45 
 
 		 56 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0248223  normal  0.847796 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2440  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2024  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3039  hypothetical protein  53.33 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1238  hypothetical protein  48.89 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0014098  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1669  hypothetical protein  42.59 
 
 		 59 aa  47.8  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00530  hypothetical protein  40 
 
 		 199 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2019  hypothetical protein  40.82 
 
 		 57 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000087016  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001948  hypothetical protein  37.5 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>