More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2057 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  100 
 
 
168 aa  347  5e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  71.43 
 
 
168 aa  259  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  68.86 
 
 
168 aa  245  3e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  68.07 
 
 
168 aa  244  4e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  58.68 
 
 
172 aa  213  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1463  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
165 aa  87  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116619  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0234  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 
163 aa  84.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.425088  normal  0.397447 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  32.45 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
148 aa  79  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  31.85 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  36.63 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  36.63 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  36.63 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  36.63 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  30.92 
 
 
147 aa  67  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000023854  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 
147 aa  67  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  36.63 
 
 
140 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2749  mutT/nudix family protein  33.59 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2498  mutT/nudix family protein  33.59 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  36.73 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0536  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  33.59 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  30.38 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  34.04 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  30.92 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1043  NUDIX family hydrolase  31.43 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2698  mutT/nudix family protein  32.82 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000763334 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  32.62 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2719  mutT/nudix family protein  37.5 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00471958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  36.73 
 
 
140 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3557  mutT/nudix family protein  27.15 
 
 
131 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3337  mutT/nudix family protein  28 
 
 
131 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000625808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  35.71 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3598  mutT/nudix family protein  28 
 
 
131 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000783119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3561  mutT/nudix family protein  28.38 
 
 
131 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3252  MutT/Nudix family protein  29.73 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000005811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  31.91 
 
 
147 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 
144 aa  61.6  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1666  mutT/nudix family protein  28.95 
 
 
132 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.00436e-21 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  30 
 
 
153 aa  60.8  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
299 aa  60.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3552  mutT/nudix family protein  28.19 
 
 
131 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6173699999999999e-43 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0227  hypothetical protein  29.37 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08300  NUDIX hydrolase  27.52 
 
 
154 aa  59.7  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  31.69 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3074  mutT/nudix family protein  28.06 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2705  mutT/nudix family protein  32.82 
 
 
147 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  32.62 
 
 
147 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2836  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 
158 aa  58.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927915  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2790  phosphohydrolase  29.52 
 
 
153 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5820  hypothetical protein  29.33 
 
 
158 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  31.94 
 
 
147 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 
162 aa  58.5  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2605  mutT/nudix family protein  32.06 
 
 
147 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000292929 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
149 aa  58.2  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2832  MutT/nudix family protein  30.41 
 
 
146 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0990574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2802  MutT/Nudix family protein  27.34 
 
 
157 aa  57.8  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3644  mutT/nudix family protein  31.91 
 
 
147 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1195  MutT/nudix family protein  31.43 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 
158 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3223  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 
170 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3302  MutT/Nudix family protein  26.67 
 
 
131 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.973400000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0751  mutT/nudix family protein  34.44 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0598  NUDIX hydrolase  30 
 
 
163 aa  56.6  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67120  hypothetical protein  28.67 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5237  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2810  mutT/nudix family protein  30.56 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00396019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3651  mutT/nudix family protein  26.85 
 
 
131 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 
173 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  34.21 
 
 
158 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2765  MutT/Nudix family protein  26.62 
 
 
157 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  34.21 
 
 
158 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  34.21 
 
 
158 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2503  phosphohydrolase  30.07 
 
 
145 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.792116 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2831  NUDIX hydrolase  25.87 
 
 
155 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 
156 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3056  mutT/nudix family protein  26.62 
 
 
157 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  30.37 
 
 
132 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 
228 aa  54.3  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
145 aa  54.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  33.64 
 
 
163 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3048  MutT/Nudix family protein  25.9 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 
141 aa  53.9  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  40.85 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  26.95 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  42.47 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  28.15 
 
 
132 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>