More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2041 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2041  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 684 aa  1405    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0999  ATP-dependent protease La  66.22 
 
 		 679 aa  984    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.48984  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0341  hypothetical protein  43.03 
 
 		 694 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.168371  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2283  ATP-dependent Lon-type protease  41.92 
 
 		 679 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1906  ATP-dependent protease La  43.52 
 
 		 687 aa  572  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.672246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5032  putative ATP-dependent Lon protease  41.7 
 
 		 686 aa  568  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0301  putative ATP-dependent Lon protease  42.15 
 
 		 676 aa  565  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2488  ATP-dependent Lon protease  41.93 
 
 		 678 aa  559  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2105  hypothetical protein  41.74 
 
 		 676 aa  550  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_258  ATP-dependent Lon protease  40.3 
 
 		 676 aa  527  1e-148  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1126  hypothetical protein  40.86 
 
 		 678 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596948  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1323  putative ATP-dependent Lon protease  37.19 
 
 		 681 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1136  putative ATP-dependent Lon protease  36.79 
 
 		 682 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.541958  hitchhiker  0.000000432292 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3231  putative ATP-dependent Lon protease  36.24 
 
 		 684 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2236  putative ATP-dependent Lon protease  36.26 
 
 		 682 aa  444  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000058517 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1077  putative ATP-dependent Lon protease  35.45 
 
 		 681 aa  422  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2752  putative ATP-dependent Lon protease  34.16 
 
 		 682 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0565  hypothetical protein  41.34 
 
 		 686 aa  405  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642014  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1675  hypothetical protein  39.61 
 
 		 689 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.404714  hitchhiker  0.000649266 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2202  hypothetical protein  39.59 
 
 		 670 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3729  alkaline phosphatase domain-containing protein  41.51 
 
 		 703 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02910  conserved hypothetical protein TIGR02688  37.91 
 
 		 694 aa  359  9.999999999999999e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000891633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4849  hypothetical protein  37.35 
 
 		 675 aa  323  7e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895704  normal  0.860028 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1245  ATP-dependent Lon-type protease  33.76 
 
 		 531 aa  252  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3353  hypothetical protein  33.26 
 
 		 508 aa  251  3e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1800  ATP-dependent protease La  31.26 
 
 		 469 aa  239  1e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186498  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1519  ATP-dependent protease La  31.25 
 
 		 470 aa  213  7e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1063  hypothetical protein  29.81 
 
 		 477 aa  202  9.999999999999999e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0757607  hitchhiker  0.000125956 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1754  hypothetical protein  27.65 
 
 		 473 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0803  ATP-dependent protease La  29.85 
 
 		 485 aa  145  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0793  ATP-dependent Lon-type protease-like protein  25.11 
 
 		 485 aa  139  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0583  ATP-dependent protease La  31.76 
 
 		 186 aa  84.7  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  28.21 
 
 		 778 aa  62.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  30.07 
 
 		 793 aa  62.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  25 
 
 		 793 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  27.01 
 
 		 801 aa  59.7  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.67 
 
 		 786 aa  58.9  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2992  ATP-dependent protease La  26.19 
 
 		 813 aa  58.9  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1659  Lon-A peptidase  27.22 
 
 		 875 aa  57.8  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.241054  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1899  ATP-dependent protease La  27.22 
 
 		 874 aa  57.8  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67239  normal  0.195756 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  25.86 
 
 		 880 aa  57.8  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0098  ATP-dependent protease La  24.07 
 
 		 815 aa  57.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000146786 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  27.88 
 
 		 775 aa  57.4  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  25.15 
 
 		 807 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  24.36 
 
 		 786 aa  56.2  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 784 aa  55.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  23.78 
 
 		 797 aa  56.6  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  25.76 
 
 		 670 aa  56.2  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0715  ATP-dependent protease La  26.95 
 
 		 790 aa  56.2  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 784 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 784 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 784 aa  55.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 799 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  25.33 
 
 		 784 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1979  ATP-dependent protease La  26.58 
 
 		 859 aa  55.5  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205373 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  26.82 
 
 		 806 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  26.82 
 
 		 806 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  24.59 
 
 		 812 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0347  ATP-dependent protease La  22.84 
 
 		 826 aa  55.5  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308867  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 784 aa  55.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  23.76 
 
 		 813 aa  55.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 784 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 784 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 784 aa  55.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 784 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 784 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2695  ATP-dependent protease La  22.54 
 
 		 811 aa  55.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 784 aa  55.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 784 aa  55.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  24.59 
 
 		 812 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2044  Lon-A peptidase  25 
 
 		 802 aa  55.1  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  22.65 
 
 		 783 aa  55.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5717  ATP-dependent protease La  24.46 
 
 		 804 aa  54.7  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.548129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  22.64 
 
 		 812 aa  54.7  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  24.24 
 
 		 800 aa  55.1  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 784 aa  55.1  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  24.14 
 
 		 803 aa  54.7  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 793 aa  54.7  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  23.64 
 
 		 820 aa  54.3  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 793 aa  54.3  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  23.46 
 
 		 774 aa  53.9  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2647  ATP-dependent protease La  24.31 
 
 		 804 aa  54.3  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  25.49 
 
 		 781 aa  53.9  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1621  ATP-dependent protease La  23.49 
 
 		 815 aa  53.9  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 787 aa  53.9  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2893  ATP-dependent protease La  23.42 
 
 		 812 aa  53.9  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.490936  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3783  ATP-dependent protease La  28.93 
 
 		 782 aa  53.5  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417007  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  24.67 
 
 		 785 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  24.67 
 
 		 785 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2576  ATP-dependent protease La  28.26 
 
 		 802 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0456726  normal  0.0149166 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  24.67 
 
 		 785 aa  53.5  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0694  ATP-dependent protease La  24.4 
 
 		 813 aa  53.9  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.243071  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  24.67 
 
 		 785 aa  53.9  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  21.47 
 
 		 810 aa  53.9  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4373  ATP-dependent protease La  25 
 
 		 816 aa  53.5  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574007  normal  0.577886 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  24.67 
 
 		 785 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  27.22 
 
 		 816 aa  53.5  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  25.34 
 
 		 783 aa  53.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  24 
 
 		 785 aa  53.9  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  24.67 
 
 		 785 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>