More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1913 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  100 
 
 
375 aa  773    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  64.53 
 
 
372 aa  514  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  60.05 
 
 
375 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  55.47 
 
 
374 aa  443  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  53.52 
 
 
354 aa  393  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  50.14 
 
 
354 aa  376  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.38 
 
 
354 aa  327  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.31 
 
 
351 aa  322  6e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.87 
 
 
351 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.72 
 
 
355 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.48 
 
 
354 aa  319  6e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  43.49 
 
 
365 aa  319  6e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.42 
 
 
367 aa  318  7e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.51 
 
 
353 aa  318  9e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.74 
 
 
353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.94 
 
 
354 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.74 
 
 
353 aa  305  7e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.07 
 
 
354 aa  301  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.09 
 
 
357 aa  297  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.58 
 
 
357 aa  296  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.25 
 
 
353 aa  292  7e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.05 
 
 
341 aa  291  1e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.79 
 
 
547 aa  290  2e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  36.61 
 
 
363 aa  286  5e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.26 
 
 
356 aa  285  8e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.41 
 
 
363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.08 
 
 
354 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.67 
 
 
354 aa  273  3e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_521  magnesium and cobalt transport protein  35.96 
 
 
354 aa  273  5.000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.015404  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1732  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.92 
 
 
355 aa  272  5.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.28 
 
 
355 aa  272  7e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.87 
 
 
354 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  39.23 
 
 
358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.9 
 
 
362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  35.19 
 
 
380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.72 
 
 
353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.1 
 
 
379 aa  251  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.14 
 
 
387 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.44 
 
 
352 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.39 
 
 
376 aa  241  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.31 
 
 
352 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0489  magnesium and cobalt transport protein CorA  36 
 
 
383 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.7 
 
 
374 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.44 
 
 
348 aa  236  6e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.75 
 
 
352 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.17 
 
 
385 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1581  magnesium/cobalt transporter CorA  35.15 
 
 
367 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0107279  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.17 
 
 
385 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.88 
 
 
395 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
360 aa  229  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.49 
 
 
390 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  33.14 
 
 
354 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  33.43 
 
 
354 aa  226  6e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  36.62 
 
 
354 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.96 
 
 
381 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1102  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.62 
 
 
351 aa  217  2.9999999999999998e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.528236  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0785  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.63 
 
 
332 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0685097  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4221  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.86 
 
 
381 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4182  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.86 
 
 
381 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.04 
 
 
357 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.58 
 
 
368 aa  207  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.85 
 
 
382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2170  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.8 
 
 
372 aa  195  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.574954 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1992  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.06 
 
 
360 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.75 
 
 
339 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.12 
 
 
327 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2667  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.84 
 
 
355 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.94 
 
 
339 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.18 
 
 
325 aa  188  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.88 
 
 
327 aa  186  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.52 
 
 
316 aa  186  8e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.97 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0969  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.01 
 
 
356 aa  183  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231272  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.56 
 
 
333 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.09 
 
 
325 aa  175  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3530  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.05 
 
 
357 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203134  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.62 
 
 
322 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.54 
 
 
321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4421  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.36 
 
 
324 aa  167  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377619  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2266  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.31 
 
 
325 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2133  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.31 
 
 
325 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2077  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.31 
 
 
325 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.69 
 
 
291 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6358  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.38 
 
 
325 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1721  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.38 
 
 
325 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1643  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.56 
 
 
325 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222374  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1735  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.38 
 
 
325 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2311  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.04 
 
 
325 aa  159  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0979  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.97 
 
 
325 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272451  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2783  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.16 
 
 
316 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000249719  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4482  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.07 
 
 
374 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00436374  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1642  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.94 
 
 
325 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1239  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.36 
 
 
325 aa  155  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2221  magnesium and cobalt transport protein CorA  29 
 
 
321 aa  155  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2264  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.32 
 
 
325 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3190  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.57 
 
 
332 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.38171  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1996  magnesium/cobalt transporter CorA  29.01 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215662  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1864  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.06 
 
 
321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1539  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.67 
 
 
325 aa  153  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.555793 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1043  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.43 
 
 
316 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000724407  decreased coverage  0.00000504287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>