More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1908 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 519 aa  1066    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  44.03 
 
 		 558 aa  332  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2437  OmpA/MotB domain-containing protein  42.36 
 
 		 460 aa  310  4e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3650  OmpA/MotB  41.49 
 
 		 444 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31620  hypothetical protein  39.55 
 
 		 464 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0612  serine/threonine protein kinase  40.61 
 
 		 734 aa  295  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0965  ompA family protein  39.24 
 
 		 562 aa  294  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2475  OmpA/MotB  40.05 
 
 		 447 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.201724  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2689  hypothetical protein  39.63 
 
 		 465 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28890  periplasmic phosphate binding protein  38.84 
 
 		 428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.938585  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  39.9 
 
 		 482 aa  283  6.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2746  OmpA family protein  40.05 
 
 		 451 aa  282  9e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0862852  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3818  OmpA/MotB domain protein  39.43 
 
 		 435 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0260085  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  39.43 
 
 		 435 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0939577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2087  OmpA/MotB domain-containing protein  39.24 
 
 		 435 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1951  OmpA/MotB domain-containing protein  39.24 
 
 		 435 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0417  OmpA/MotB domain protein  30.79 
 
 		 585 aa  207  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.846597  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2919  OmpA/MotB  29.32 
 
 		 517 aa  172  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2763  OmpA/MotB domain-containing protein  31.21 
 
 		 499 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.621533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  32.62 
 
 		 268 aa  134  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2832  OmpA/MotB domain-containing protein  27.06 
 
 		 512 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  31.06 
 
 		 558 aa  133  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0287  OmpA/MotB  26.07 
 
 		 513 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791122 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  36.52 
 
 		 272 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  35.53 
 
 		 271 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  35 
 
 		 272 aa  130  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  36.84 
 
 		 272 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  34.55 
 
 		 283 aa  125  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  36.49 
 
 		 381 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  32.05 
 
 		 272 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  35.19 
 
 		 290 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  32.62 
 
 		 264 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  34.36 
 
 		 271 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  32.76 
 
 		 290 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  32.02 
 
 		 218 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  36.53 
 
 		 301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.46 
 
 		 272 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  31.75 
 
 		 280 aa  118  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  34.21 
 
 		 278 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  33.77 
 
 		 284 aa  117  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  33.89 
 
 		 330 aa  117  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  34.1 
 
 		 272 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1170  OmpA family protein  29.7 
 
 		 512 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  32.55 
 
 		 285 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  32.73 
 
 		 273 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  30.04 
 
 		 281 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  34.21 
 
 		 276 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  31.42 
 
 		 272 aa  115  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  33.04 
 
 		 279 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  30.26 
 
 		 270 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  33.77 
 
 		 276 aa  113  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  30.91 
 
 		 299 aa  113  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  32.19 
 
 		 276 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  34.93 
 
 		 303 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  31.74 
 
 		 285 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  29.64 
 
 		 281 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  35.11 
 
 		 332 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  34.15 
 
 		 281 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  32.37 
 
 		 273 aa  110  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  29.1 
 
 		 279 aa  109  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  32.73 
 
 		 284 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  31.25 
 
 		 287 aa  109  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.8 
 
 		 278 aa  108  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  31.86 
 
 		 270 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.8 
 
 		 285 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  28.63 
 
 		 273 aa  107  5e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  34.27 
 
 		 284 aa  106  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  32.3 
 
 		 307 aa  104  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3997  phosphate binding protein  31.89 
 
 		 651 aa  104  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  29.82 
 
 		 277 aa  103  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  34.07 
 
 		 272 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  34.35 
 
 		 272 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  30.93 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4157  phosphate binding protein  36.91 
 
 		 666 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.16838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  33.63 
 
 		 272 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  35.2 
 
 		 281 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  31.07 
 
 		 278 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  30.33 
 
 		 282 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  31.54 
 
 		 269 aa  101  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  30.55 
 
 		 273 aa  101  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  31.58 
 
 		 267 aa  100  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  30.87 
 
 		 277 aa  99.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3450  phosphate binding protein  31.19 
 
 		 323 aa  99  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00138297  hitchhiker  0.000178512 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  31.46 
 
 		 292 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0589  phosphate binding protein  35.19 
 
 		 669 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208042  normal  0.476914 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  34.47 
 
 		 270 aa  97.4  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0179  phosphate binding protein  30.69 
 
 		 322 aa  97.1  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  28.83 
 
 		 273 aa  96.3  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3301  phosphate binding protein  30.85 
 
 		 323 aa  95.9  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212023  decreased coverage  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0979  phosphate binding protein  27.75 
 
 		 302 aa  95.9  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.113095 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  31.33 
 
 		 274 aa  95.9  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2553  phosphate binding protein  32.68 
 
 		 323 aa  95.1  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177722  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0960  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.39 
 
 		 325 aa  94.7  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  32.92 
 
 		 302 aa  94.4  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  28.94 
 
 		 281 aa  94.7  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0618  phosphate binding protein  32.01 
 
 		 321 aa  94  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.57 
 
 		 279 aa  93.2  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5376  phosphate binding protein  30.33 
 
 		 332 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572014 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  29.18 
 
 		 278 aa  93.2  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1298  phosphate binding protein  29.14 
 
 		 323 aa  93.2  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000202068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>