More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1868 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1868  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
214 aa  447  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0849  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  83.33 
 
 
204 aa  333  1e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.478766  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0748  NADH dehydrogenase I, 23 kDa subunit  79.79 
 
 
215 aa  330  1e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0663898  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0639  NADH dehydrogenase I, 23 kDa subunit  86.98 
 
 
200 aa  325  3e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0966  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  77.47 
 
 
228 aa  315  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000162205  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0847  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  76.11 
 
 
206 aa  302  3.0000000000000004e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.879675  normal  0.609652 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1602  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  75.72 
 
 
206 aa  291  5e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4037  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.11 
 
 
513 aa  186  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158153 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2619  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I  47.57 
 
 
427 aa  180  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.487115  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.4 
 
 
507 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1026  hypothetical protein  44.51 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  28.74 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  28.74 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  28.74 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  28.74 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  28.05 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  29.31 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.21 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  27.27 
 
 
182 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1197  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  30.52 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  26.82 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1284  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.11 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218939  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  30.34 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  30.34 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  29.78 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.7 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
179 aa  67.8  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2041  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.79 
 
 
165 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000212693  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1333  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.82 
 
 
176 aa  67  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  31.71 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.43 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  28.21 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  28.21 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  28.21 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  26.47 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  28.21 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1526  NADH dehydrogenase subunit I  25.71 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  27.2 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02321  NADH dehydrogenase subunit I  26.74 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3814  NADH dehydrogenase subunit I  35.77 
 
 
139 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  27.56 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  27.56 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  28.69 
 
 
171 aa  64.3  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  27.56 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  29.03 
 
 
177 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  27.56 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02206  NADH dehydrogenase subunit I  27.56 
 
 
180 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  27.56 
 
 
180 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5471  NADH dehydrogenase subunit I  35.77 
 
 
139 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5386  NADH dehydrogenase subunit I  35.77 
 
 
139 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1901e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5420  NADH dehydrogenase subunit I  35.77 
 
 
139 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5145  NADH dehydrogenase subunit I  35.77 
 
 
139 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4977  NADH dehydrogenase subunit I  35.77 
 
 
139 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4995  NADH dehydrogenase subunit I  35.77 
 
 
139 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  26.92 
 
 
180 aa  63.5  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1371  NADH dehydrogenase subunit I  27.56 
 
 
180 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  0.392913 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3420  NADH dehydrogenase subunit I  27.56 
 
 
180 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  29.27 
 
 
180 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2657  NADH dehydrogenase subunit I  27.56 
 
 
180 aa  63.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  27.56 
 
 
180 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5534  NADH dehydrogenase subunit I  35.77 
 
 
139 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0249659 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5537  NADH dehydrogenase subunit I  35.77 
 
 
139 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  26.8 
 
 
181 aa  63.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.82 
 
 
226 aa  63.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  27.56 
 
 
180 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  27.56 
 
 
180 aa  63.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0468  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.05 
 
 
216 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0616317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5093  NADH dehydrogenase subunit I  35.77 
 
 
139 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2574  NADH dehydrogenase subunit I  27.56 
 
 
180 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  26.8 
 
 
175 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  27.56 
 
 
180 aa  63.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5416  NADH dehydrogenase subunit I  35.77 
 
 
139 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  28.66 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2435  NADH dehydrogenase subunit I  27.56 
 
 
180 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0320  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.49 
 
 
234 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.562709 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01791  NADH dehydrogenase subunit I  31.93 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  31.93 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  32.48 
 
 
160 aa  63.2  0.000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01881  NADH dehydrogenase subunit I  31.93 
 
 
208 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  31.93 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3408  NADH dehydrogenase subunit I  31.25 
 
 
139 aa  62.8  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  27.5 
 
 
234 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1344  NADH dehydrogenase subunit I  27.16 
 
 
202 aa  62.8  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1054  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.66 
 
 
180 aa  62.4  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2765  NADH dehydrogenase subunit I  26.28 
 
 
180 aa  62  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1296  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.89 
 
 
238 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109179  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.48 
 
 
194 aa  62  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1499  NADH dehydrogenase subunit I  26.28 
 
 
180 aa  62  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1272  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.84 
 
 
270 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0281  NADH dehydrogenase subunit I  31.4 
 
 
210 aa  61.6  0.000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0400  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.93 
 
 
216 aa  61.6  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1373  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.84 
 
 
267 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.340666  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.41 
 
 
175 aa  61.6  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  29.19 
 
 
252 aa  61.6  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2411  NADH dehydrogenase subunit I  31.4 
 
 
215 aa  61.6  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2622  NADH dehydrogenase subunit I  32.58 
 
 
163 aa  61.6  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2249  NADH dehydrogenase subunit I  32.58 
 
 
163 aa  61.6  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.650546  hitchhiker  0.0000391532 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  28.46 
 
 
180 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  29.22 
 
 
163 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  28.93 
 
 
162 aa  61.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>