88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1831 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 149 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  65.54 
 
 		 147 aa  187  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.56 
 
 		 166 aa  168  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 		 148 aa  153  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2628  cupin 2 domain-containing protein  45.89 
 
 		 157 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.074736  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.15 
 
 		 231 aa  114  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.57 
 
 		 140 aa  98.2  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.4 
 
 		 137 aa  84.7  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.74 
 
 		 150 aa  83.6  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  35 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.86 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  33.09 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  29.77 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2157  cupin 2, barrel  38.1 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.06 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.17 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1978  cupin 2 domain-containing protein  29.85 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.78 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  36.73 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  31.51 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  31.51 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3293  cupin 2 domain-containing protein  25.93 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  33.09 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2224  hypothetical protein  37.65 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  29.32 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.58 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  29.63 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  31.15 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  37.97 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  29.46 
 
 		 156 aa  51.2  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12971  hypothetical protein  30.99 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.298883  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  32.53 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  33.04 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  32.46 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  32.53 
 
 		 136 aa  47.4  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1547  hypothetical protein  44.07 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683626  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5003  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.71 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190773  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  33.9 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04261  hypothetical protein  31.3 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.648244  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00650  hypothetical protein  26.42 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.34 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0053  hypothetical protein  26.42 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  29.58 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6988  cupin 2 domain-containing protein  31.67 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 257 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  31.67 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.18 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  32.14 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  27.78 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  27.78 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  30.85 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  27.78 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.2 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.21 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.29 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3213  normal  0.701172 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  29.81 
 
 		 143 aa  42  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  30 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  29.81 
 
 		 143 aa  42  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  33.01 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 138 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.48 
 
 		 137 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234364  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.67 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  29.76 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 147 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  35.09 
 
 		 138 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4486  cupin 2 domain-containing protein  32.61 
 
 		 135 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801691  normal  0.97198 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  25.56 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0588  cupin 2 domain-containing protein  26.17 
 
 		 173 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00966189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  27.38 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3184  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.29 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.93212 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  30.38 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16041  hypothetical protein  23.31 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  25.56 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  29.49 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1080  hypothetical protein  31.76 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.85 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  29.27 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2102  cupin 2 domain-containing protein  29.25 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5021  cupin region  35.56 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00533136  normal  0.0498556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  34.92 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4403  cupin 2 domain-containing protein  32.32 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707936  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4247  cupin 2 domain-containing protein  32.32 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4181  cupin 2, barrel  32.32 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.67 
 
 		 139 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  36.36 
 
 		 135 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2099  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 		 136 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>