67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1820 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1821  gas vesicle synthesis protein GvpA  100 
 
 		 68 aa  126  9.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228865  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1820  gas vesicle synthesis protein GvpA  100 
 
 		 68 aa  126  9.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000245848  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1819  gas vesicle synthesis protein GvpA  100 
 
 		 68 aa  126  9.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1818  gas vesicle synthesis protein GvpA  100 
 
 		 68 aa  126  9.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025131  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0689  gas vesicle synthesis protein GvpA  98.53 
 
 		 68 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.021084  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0688  gas vesicle synthesis protein GvpA  98.53 
 
 		 68 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0200953  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0686  gas vesicle synthesis protein GvpA  97.06 
 
 		 68 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0189096  normal  0.509379 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0079  gas vesicle synthesis protein GvpA  86.76 
 
 		 71 aa  114  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.0117948 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0078  gas vesicle synthesis protein GvpA  85.29 
 
 		 71 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00750449  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2839  gas vesicle synthesis protein GvpA  83.58 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2325  gas vesicle synthesis protein GvpA  82.35 
 
 		 72 aa  107  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740835  unclonable  0.0000203995 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1253  gas vesicle synthesis protein GvpA  80.6 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3016  gas vesicle protein GVPa  79.41 
 
 		 71 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2324  gas vesicle synthesis protein GvpA  84.38 
 
 		 75 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112837  hitchhiker  0.000242369 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1748  gas vesicle synthesis protein GvpA  76.12 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3573  gas vesicle synthesis protein GvpA  72.06 
 
 		 70 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3255  gas vesicle synthesis protein GvpA  72.06 
 
 		 70 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2404  gas vesicle protein GVPa  67.69 
 
 		 98 aa  98.6  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1499  gas vesicle protein GVPa  74.6 
 
 		 76 aa  96.3  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1498  gas vesicle protein GVPa  74.6 
 
 		 75 aa  95.9  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.921273  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0327  gas vesicle synthesis protein GvpA  74.58 
 
 		 76 aa  87.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.516569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0328  gas vesicle synthesis protein GvpA  74.58 
 
 		 76 aa  87.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.518273 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0326  gas vesicle synthesis protein GvpA  74.58 
 
 		 76 aa  87.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3114  gas vesicle protein GVPa  65.15 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0060  gas vesicle synthesis protein GvpA  65.15 
 
 		 76 aa  84.7  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.537884  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2374  gas vesicle protein GVPa  72.88 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0334  gas vesicle protein GVPa  64.06 
 
 		 95 aa  84  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0061  gas vesicle synthesis protein GvpA  68.33 
 
 		 74 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0062  gas vesicle synthesis protein GvpA  68.33 
 
 		 74 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0063  gas vesicle synthesis protein GvpA  68.33 
 
 		 74 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4706  gas vesicle protein GVPa  68.52 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.783958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2375  gas vesicle synthesis-like protein  66.04 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721458  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2334  gas vesicle synthesis-like protein  66.04 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2381  gas vesicle synthesis-like protein  66.04 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6855  hypothetical protein  71.43 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4008  gas vesicle synthesis-like protein  62.26 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3382  gas vesicle protein GVPa  72.92 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0355765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1006  gas vesicle synthesis-like protein  52.46 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2323  gas vesicle protein GVPa  67.35 
 
 		 54 aa  70.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000151045  hitchhiker  0.000256299 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2356  gas vesicle protein GVPa  62.75 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0939575 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3025  gas vesicle protein GVPa  53.45 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.749024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2828  gas vesicle protein GVPa  48.39 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2322  gas vesicle protein GVPa  64.29 
 
 		 62 aa  53.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000661358  hitchhiker  0.000258705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2405  gas vesicle protein GVPa  47.37 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2825  gas vesicle protein GVPa  49.02 
 
 		 75 aa  50.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0685  hypothetical protein  75 
 
 		 60 aa  50.8  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.056491  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0070  gas vesicle protein GVPa  52.08 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471557  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1489  gas vesicle protein GVPa  42.11 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.510909  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0335  hypothetical protein  48 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.942024 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3580  gas vesicle protein GVPa  44.23 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3264  gas vesicle protein GVPa  42.31 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal  0.701046 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0339  gas vesicle protein GVPa  37.5 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1262  gas vesicle protein GVPa  39.22 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026389  normal  0.71927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3386  gas vesicle protein GVPa  45.65 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.128813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4702  gas vesicle protein GVPa  46.67 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0071  gas vesicle protein GVPa  41.38 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0463018  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2379  gas vesicle protein GVPa  45.45 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2338  gas vesicle protein GVPa  45.45 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2385  gas vesicle protein GVPa  45.45 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2335  gas vesicle protein GVPa  38.1 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00675738 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0339  hypothetical protein  38 
 
 		 181 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.881514  normal  0.486472 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2369  gas vesicle protein GVPa  41.67 
 
 		 201 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6859  hypothetical protein  46.67 
 
 		 178 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2351  gas vesicle protein GVPa  45.45 
 
 		 147 aa  42.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3022  gas vesicle protein GVPa  34.69 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0704  hypothetical protein  41.82 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1485  gas vesicle protein GVPa  36.73 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0249757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>