More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1777 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
432 aa  879    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  52.31 
 
 
420 aa  431  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  48.46 
 
 
408 aa  365  1e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  44.58 
 
 
438 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  39.38 
 
 
412 aa  264  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0951  pentapeptide repeat protein  35.88 
 
 
393 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  34.03 
 
 
408 aa  171  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  31.51 
 
 
389 aa  158  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  29.48 
 
 
450 aa  158  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  33.1 
 
 
447 aa  150  6e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  30.32 
 
 
447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  30.23 
 
 
442 aa  146  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  31.7 
 
 
446 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  31.51 
 
 
862 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  30.62 
 
 
295 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  30.53 
 
 
381 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  29.31 
 
 
440 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  39.31 
 
 
260 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  30.38 
 
 
449 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  34.6 
 
 
300 aa  103  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  39.53 
 
 
279 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  39.53 
 
 
279 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  34.67 
 
 
441 aa  97.1  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  31.41 
 
 
336 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  31.41 
 
 
336 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 
264 aa  96.3  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  35.53 
 
 
243 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  29.56 
 
 
401 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  30.23 
 
 
309 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  29.83 
 
 
401 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  34.83 
 
 
210 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  36.93 
 
 
218 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  40.72 
 
 
286 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  33.67 
 
 
285 aa  91.7  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  30.14 
 
 
311 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  41.61 
 
 
489 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  34.43 
 
 
206 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  35.03 
 
 
268 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  44.53 
 
 
277 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  41.1 
 
 
357 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  27.49 
 
 
333 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  28.77 
 
 
515 aa  87.8  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  42.66 
 
 
517 aa  87.8  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
567 aa  87.8  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  25.96 
 
 
607 aa  87.4  4e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0521  hypothetical protein  36.14 
 
 
195 aa  87  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  42.68 
 
 
241 aa  87  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  29.09 
 
 
420 aa  86.7  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  42.57 
 
 
521 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  39.1 
 
 
184 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  33.16 
 
 
262 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  28.24 
 
 
392 aa  84.7  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  33.16 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  34.42 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  38.25 
 
 
493 aa  83.6  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  38.37 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  34.62 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  39.86 
 
 
745 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  29.76 
 
 
351 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  39.75 
 
 
225 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  39.31 
 
 
222 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  39.51 
 
 
576 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  29.81 
 
 
401 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  39.66 
 
 
1033 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  30.65 
 
 
483 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  29.81 
 
 
401 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  27.78 
 
 
389 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  35.96 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  37.09 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  42.75 
 
 
973 aa  80.5  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  38.2 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  27.06 
 
 
419 aa  80.1  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  39.64 
 
 
727 aa  79.7  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 
216 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  28.11 
 
 
448 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  28.67 
 
 
493 aa  79.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  25.89 
 
 
872 aa  78.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  32.59 
 
 
870 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  37.11 
 
 
215 aa  79  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  38.22 
 
 
320 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0870  pentapeptide repeat protein  43.56 
 
 
362 aa  79  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
386 aa  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
175 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  33.9 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7498  pentapeptide repeat protein  37.93 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  25.14 
 
 
433 aa  77.4  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  34.46 
 
 
356 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  34.36 
 
 
456 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  34.46 
 
 
356 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.3 
 
 
525 aa  76.6  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  36.22 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  39.85 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  40.67 
 
 
362 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  40.51 
 
 
213 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  38.12 
 
 
203 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  38.93 
 
 
433 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2141  pentapeptide repeat-containing protein  30.24 
 
 
222 aa  76.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>