More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1638 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
229 aa  457  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  78.51 
 
 
229 aa  311  3.9999999999999997e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  75.44 
 
 
229 aa  311  5.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  75.33 
 
 
229 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  69.3 
 
 
233 aa  295  3e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  71.05 
 
 
229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  70.61 
 
 
229 aa  245  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  44.64 
 
 
236 aa  168  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  49.24 
 
 
209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  45.78 
 
 
230 aa  150  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  48.61 
 
 
263 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  43.69 
 
 
218 aa  139  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  40.7 
 
 
215 aa  139  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  46.45 
 
 
225 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  37.84 
 
 
233 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  45.57 
 
 
224 aa  135  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  46.89 
 
 
223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  39.23 
 
 
227 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  40 
 
 
205 aa  122  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  40.94 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  40.24 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  40.65 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  40.24 
 
 
228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  45.39 
 
 
215 aa  118  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  40.5 
 
 
225 aa  118  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  42.67 
 
 
231 aa  116  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  34.38 
 
 
228 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  34.82 
 
 
228 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  34.82 
 
 
228 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  42.46 
 
 
215 aa  114  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 
223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  45.52 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  37.79 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  37.84 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  36.53 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  40.13 
 
 
224 aa  110  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  43.93 
 
 
216 aa  109  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  36.51 
 
 
241 aa  109  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  37.04 
 
 
222 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  44.53 
 
 
236 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  37.36 
 
 
231 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  40.09 
 
 
218 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  41.78 
 
 
223 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  37.08 
 
 
351 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  42.75 
 
 
221 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  39.57 
 
 
225 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  38.57 
 
 
217 aa  106  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0934  OmpA/MotB domain-containing protein  44.29 
 
 
217 aa  103  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000729955  hitchhiker  0.000000173865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  45.11 
 
 
222 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  44.2 
 
 
222 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  33.33 
 
 
345 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  44.92 
 
 
344 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  46.49 
 
 
327 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  44.92 
 
 
344 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  44.92 
 
 
344 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  42.86 
 
 
221 aa  102  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 
222 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  41.56 
 
 
205 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  35.45 
 
 
225 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  39.86 
 
 
220 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  46.38 
 
 
219 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  40.15 
 
 
222 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  44.36 
 
 
237 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  48.54 
 
 
288 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  44.36 
 
 
237 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  39.42 
 
 
221 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  34.44 
 
 
350 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  45.79 
 
 
209 aa  99.8  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  40.58 
 
 
221 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  37.96 
 
 
226 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  42.22 
 
 
217 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  34.44 
 
 
350 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  39.86 
 
 
243 aa  99.8  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  43.22 
 
 
344 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  44.07 
 
 
344 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  41.67 
 
 
331 aa  98.2  9e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  39.86 
 
 
221 aa  98.2  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  37.68 
 
 
175 aa  97.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  39.86 
 
 
221 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  36.24 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  47.75 
 
 
320 aa  97.4  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  42.37 
 
 
344 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  44.07 
 
 
210 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  40.15 
 
 
429 aa  96.7  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  40.74 
 
 
447 aa  96.7  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  42.75 
 
 
227 aa  96.3  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  38.73 
 
 
218 aa  95.9  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  38.31 
 
 
206 aa  94.7  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  38.31 
 
 
206 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  41.77 
 
 
237 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 
360 aa  94.4  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  36.53 
 
 
224 aa  94.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  36.31 
 
 
223 aa  94.4  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  34.22 
 
 
230 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  34.22 
 
 
230 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  34.22 
 
 
230 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  34.22 
 
 
230 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.96 
 
 
248 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>