153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1574 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1574  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  100 
 
 
289 aa  600  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000030231  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1072  sialic acid synthase  84.08 
 
 
293 aa  513  1e-144  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0797  N-acetylneuraminate synthase  81.66 
 
 
289 aa  509  1e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1274  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  80.28 
 
 
314 aa  499  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1187  N-acetylneuraminate synthase  78.89 
 
 
289 aa  497  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0910  N-acetylneuraminate synthase  74.31 
 
 
289 aa  466  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.497689  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0346  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  65.38 
 
 
313 aa  394  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.417711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0010  n-acetylneuraminate synthase  58.33 
 
 
303 aa  354  1e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  58.25 
 
 
672 aa  347  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0843  N-acetylneuraminate synthase  56.6 
 
 
296 aa  322  4e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2841  N-acetylneuraminate synthase  53.85 
 
 
300 aa  298  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893161  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1346  N-acetylneuraminate synthase  44.01 
 
 
289 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.107531  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2713  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  46.69 
 
 
310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.314547  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  37.41 
 
 
349 aa  211  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.6 
 
 
394 aa  206  5e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  37.99 
 
 
337 aa  203  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  37.14 
 
 
333 aa  199  6e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  37.33 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  39.16 
 
 
330 aa  192  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  37.64 
 
 
334 aa  192  7e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  38.62 
 
 
748 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.3 
 
 
334 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.3 
 
 
334 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.06 
 
 
749 aa  188  8e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3448  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.14 
 
 
749 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2668  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.14 
 
 
749 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  34.39 
 
 
347 aa  185  9e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.84 
 
 
332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  36.01 
 
 
346 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  36.69 
 
 
331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  38.37 
 
 
341 aa  183  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.52 
 
 
354 aa  182  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  37.36 
 
 
333 aa  181  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  34.77 
 
 
334 aa  180  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.44 
 
 
342 aa  180  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  36.92 
 
 
337 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  35.32 
 
 
334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  36.75 
 
 
350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.07 
 
 
335 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  35.13 
 
 
333 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  36.7 
 
 
350 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  36.77 
 
 
348 aa  175  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  35.44 
 
 
346 aa  175  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2221  N-acetylneuraminate synthase  36.08 
 
 
761 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.08 
 
 
338 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.88 
 
 
334 aa  172  7.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  36.12 
 
 
345 aa  169  6e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  37.92 
 
 
351 aa  168  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  33.58 
 
 
338 aa  167  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.97 
 
 
350 aa  167  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  32.18 
 
 
350 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  34.58 
 
 
349 aa  163  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.03 
 
 
350 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  32.27 
 
 
340 aa  162  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  32.98 
 
 
340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  36.64 
 
 
350 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  37.19 
 
 
349 aa  162  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.95 
 
 
762 aa  162  8.000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.147767  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  32.67 
 
 
348 aa  162  8.000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  34.42 
 
 
351 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  33.44 
 
 
359 aa  161  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  34.05 
 
 
333 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.13 
 
 
350 aa  160  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  35.96 
 
 
350 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.66 
 
 
358 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.51 
 
 
338 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  32.88 
 
 
350 aa  156  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.42 
 
 
358 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  34.93 
 
 
352 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08721  ialic acid synthase  31.11 
 
 
342 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  hitchhiker  0.00000164183 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.85 
 
 
344 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1277  sialic acid synthase  35.23 
 
 
288 aa  153  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0210  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.36 
 
 
349 aa  153  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.803069  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0367  N-acetylneuraminate synthase  34.77 
 
 
360 aa  153  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.45 
 
 
355 aa  152  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  33.94 
 
 
337 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.25 
 
 
357 aa  152  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  35.33 
 
 
349 aa  152  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0408  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.16 
 
 
292 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  34.13 
 
 
350 aa  149  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.21 
 
 
350 aa  149  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.03 
 
 
359 aa  149  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  31.02 
 
 
349 aa  148  8e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0169  N-acetylneuraminic acid synthase  32.13 
 
 
357 aa  148  8e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.922982  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0254  N-acetylneuraminic acid synthase  32.13 
 
 
357 aa  148  8e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0169  N-acetylneuraminic acid synthetase  35.77 
 
 
344 aa  148  9e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0138828  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37 
 
 
350 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  31.48 
 
 
357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4853  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.51 
 
 
352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.16 
 
 
351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  31.5 
 
 
343 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  33.44 
 
 
363 aa  145  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07305  N-acetylneuraminic acid phosphate synthase  33.93 
 
 
291 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  32.16 
 
 
332 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  37.67 
 
 
364 aa  143  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.75 
 
 
349 aa  143  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0565  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsE  34.62 
 
 
342 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01101  sialic acid synthase  31.8 
 
 
335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  31.77 
 
 
359 aa  140  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3100  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.28 
 
 
357 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>