More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1505 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0823  leucyl aminopeptidase  67.32 
 
 		 528 aa  690    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  68.19 
 
 		 503 aa  660    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  100 
 
 		 503 aa  1009    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  66.47 
 
 		 503 aa  634  1e-180  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0954  leucyl aminopeptidase  64.38 
 
 		 508 aa  600  1e-170  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0999  leucyl aminopeptidase  59 
 
 		 511 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  43.08 
 
 		 487 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  42.29 
 
 		 488 aa  371  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4525  Leucyl aminopeptidase  40.72 
 
 		 491 aa  364  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2787  leucyl aminopeptidase  52.46 
 
 		 499 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151843  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  43.79 
 
 		 497 aa  354  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  45 
 
 		 518 aa  353  5e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  42.7 
 
 		 491 aa  351  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1710  Leucyl aminopeptidase  43.47 
 
 		 501 aa  348  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.055191  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  43.26 
 
 		 496 aa  347  3e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  44.2 
 
 		 501 aa  345  8e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  44.55 
 
 		 482 aa  345  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  42.14 
 
 		 492 aa  342  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  44.35 
 
 		 495 aa  340  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  43.02 
 
 		 496 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  40 
 
 		 493 aa  335  1e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2847  Leucyl aminopeptidase  52.85 
 
 		 462 aa  332  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  42.76 
 
 		 496 aa  332  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0628  leucyl aminopeptidase  41.2 
 
 		 496 aa  330  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.052928  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2683  leucyl aminopeptidase  41.72 
 
 		 510 aa  330  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417849  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  42.32 
 
 		 492 aa  329  6e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0568  leucyl aminopeptidase  38.71 
 
 		 514 aa  329  8e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2519  leucyl aminopeptidase  41.87 
 
 		 522 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.164338  normal  0.0174769 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1857  Leucyl aminopeptidase  42.86 
 
 		 500 aa  327  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2201  cytosol aminopeptidase  42.86 
 
 		 500 aa  327  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152379  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1538  Leucyl aminopeptidase  39.96 
 
 		 521 aa  326  7e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  39.57 
 
 		 497 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  41.45 
 
 		 498 aa  324  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  41.08 
 
 		 506 aa  323  3e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2099  aminopeptidase A/I  40.24 
 
 		 497 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41187  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  40.09 
 
 		 503 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2807  leucyl aminopeptidase  40.69 
 
 		 510 aa  319  7.999999999999999e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.494526  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  39.26 
 
 		 497 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0984  leucyl aminopeptidase  40.99 
 
 		 508 aa  318  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  40.6 
 
 		 503 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2219  leucyl aminopeptidase  43.33 
 
 		 502 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2679  leucyl aminopeptidase  43.33 
 
 		 502 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  39.07 
 
 		 497 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  40.6 
 
 		 503 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  40.6 
 
 		 503 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  45.88 
 
 		 503 aa  316  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1124  leucyl aminopeptidase  42.61 
 
 		 485 aa  316  5e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.67356  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0672  leucyl aminopeptidase  40.6 
 
 		 503 aa  316  6e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131904  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  40.6 
 
 		 503 aa  316  6e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  40.6 
 
 		 503 aa  316  6e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  40.6 
 
 		 503 aa  316  6e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  39.07 
 
 		 497 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  43.24 
 
 		 500 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  39.65 
 
 		 496 aa  313  3.9999999999999997e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  41.95 
 
 		 497 aa  313  4.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2081  leucyl aminopeptidase  38.36 
 
 		 505 aa  313  5.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0823  leucyl aminopeptidase  40.3 
 
 		 503 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  39.18 
 
 		 496 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3638  leucyl aminopeptidase  39.35 
 
 		 508 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1233  Leucyl aminopeptidase  45.75 
 
 		 536 aa  311  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  43.97 
 
 		 496 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0038  leucyl aminopeptidase  40.92 
 
 		 504 aa  311  2e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  41.67 
 
 		 495 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  40.48 
 
 		 511 aa  310  4e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  44.52 
 
 		 497 aa  310  5e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  44.34 
 
 		 497 aa  310  5e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0623  leucyl aminopeptidase  46.7 
 
 		 536 aa  310  5e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022147  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0910  leucyl aminopeptidase  38.38 
 
 		 502 aa  310  5e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000452493  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  40.26 
 
 		 503 aa  309  9e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0332  leucyl aminopeptidase  44.35 
 
 		 496 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00199325  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  38.82 
 
 		 496 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2730  Leucyl aminopeptidase  48.06 
 
 		 511 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.387562  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0296  leucyl aminopeptidase  38.33 
 
 		 488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00770459 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  40.26 
 
 		 503 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14470  leucyl aminopeptidase  41.45 
 
 		 495 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  40.83 
 
 		 496 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0913  leucyl aminopeptidase  38.46 
 
 		 497 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00605227  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  39.7 
 
 		 503 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3562  leucyl aminopeptidase  39.57 
 
 		 501 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.025023  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03635  leucyl aminopeptidase  39.61 
 
 		 502 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_901  cytosol aminopeptidase/leucyl aminopeptidase  38.34 
 
 		 495 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0210903  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2206  Leucyl aminopeptidase  41.51 
 
 		 501 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00206778  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  43.15 
 
 		 498 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  41.32 
 
 		 497 aa  305  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  40.86 
 
 		 496 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0740  leucyl aminopeptidase  39.12 
 
 		 501 aa  305  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0939  leucyl aminopeptidase  37.77 
 
 		 502 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.245826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3557  leucyl aminopeptidase  41.15 
 
 		 502 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002428  cytosol aminopeptidase PepA  39.39 
 
 		 502 aa  304  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00175472  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  44.64 
 
 		 495 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0526  leucyl aminopeptidase  39.17 
 
 		 502 aa  303  6.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0735759  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1125  Leucyl aminopeptidase  41.63 
 
 		 491 aa  303  6.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.013782  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  40.65 
 
 		 500 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2471  leucyl aminopeptidase  43.41 
 
 		 503 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1030  cytosol aminopeptidase family protein  37.72 
 
 		 495 aa  302  9e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.414121  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1014  leucyl aminopeptidase  37.72 
 
 		 502 aa  301  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0465604  normal  0.808003 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4097  leucyl aminopeptidase  40.04 
 
 		 518 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.128156  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3886  Leucyl aminopeptidase  47.56 
 
 		 524 aa  301  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.384144  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1855  leucyl aminopeptidase  38.49 
 
 		 503 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2466  leucyl aminopeptidase  38.49 
 
 		 503 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>