More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1500 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
207 aa  417  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  58.62 
 
 
217 aa  236  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  57.64 
 
 
206 aa  222  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  56.85 
 
 
202 aa  221  5e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  57.87 
 
 
212 aa  221  8e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  56.35 
 
 
206 aa  220  1e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  60.59 
 
 
210 aa  204  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.9 
 
 
346 aa  163  2e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.79 
 
 
343 aa  161  8e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.55 
 
 
365 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  46.49 
 
 
213 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50.92 
 
 
210 aa  158  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  7.28866e-05 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.47 
 
 
211 aa  158  7e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.86 
 
 
210 aa  156  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.71 
 
 
205 aa  156  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.21 
 
 
343 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.21 
 
 
343 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.27 
 
 
352 aa  152  5e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.69 
 
 
218 aa  151  6e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.88 
 
 
379 aa  151  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.35 
 
 
207 aa  150  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.66 
 
 
212 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40 
 
 
197 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149529  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.15 
 
 
208 aa  150  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.13 
 
 
218 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.21 
 
 
220 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.17 
 
 
352 aa  149  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.13 
 
 
252 aa  149  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.82 
 
 
206 aa  148  5e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.037147  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0061  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.5 
 
 
205 aa  148  7e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221396  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1529  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.67 
 
 
207 aa  147  8e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.691821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.76 
 
 
211 aa  147  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.23 
 
 
221 aa  147  1e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.18 
 
 
206 aa  147  1e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.29 
 
 
223 aa  147  1e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.47 
 
 
347 aa  147  1e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.7 
 
 
206 aa  147  1e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.61 
 
 
220 aa  147  2e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.1 
 
 
207 aa  146  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_688  ThiE-associated domain protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.62 
 
 
352 aa  145  4e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  7.36904e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.41 
 
 
344 aa  145  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.51 
 
 
353 aa  144  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  42.79 
 
 
208 aa  145  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.96 
 
 
351 aa  144  7e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.48 
 
 
350 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  43.59 
 
 
478 aa  143  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  39.11 
 
 
209 aa  142  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0708  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.98 
 
 
352 aa  142  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.78 
 
 
360 aa  142  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.09 
 
 
346 aa  142  4e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14731  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.1 
 
 
351 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.161501  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.8 
 
 
207 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.98 
 
 
220 aa  141  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.3 
 
 
228 aa  141  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.57 
 
 
350 aa  141  9e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.7 
 
 
236 aa  140  1e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.29 
 
 
368 aa  140  1e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.31 
 
 
215 aa  140  2e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.46383e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.23 
 
 
221 aa  140  2e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0604  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.6 
 
 
536 aa  139  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.37 
 
 
208 aa  139  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0645  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.09 
 
 
216 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1122  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.89 
 
 
208 aa  138  6e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4827  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.3 
 
 
224 aa  138  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 
497 aa  137  9e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40 
 
 
211 aa  136  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.92 
 
 
206 aa  136  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.34 
 
 
206 aa  135  3e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.92 
 
 
214 aa  135  4e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.78 
 
 
353 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1223  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.44 
 
 
217 aa  135  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  43.39 
 
 
492 aa  135  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.64 
 
 
219 aa  134  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0342  thiamine monophosphate synthase  41.71 
 
 
206 aa  134  1e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1657  hypothetical protein  40.59 
 
 
210 aa  134  1e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  9.01813e-06 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  42.19 
 
 
484 aa  133  2e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0547  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.68 
 
 
178 aa  132  4e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000291317  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.57 
 
 
218 aa  132  4e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.57 
 
 
219 aa  132  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  42.7 
 
 
484 aa  131  7e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1691  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.71 
 
 
209 aa  131  8e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0247781  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0797  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.02 
 
 
217 aa  131  9e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.961406 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  39.49 
 
 
204 aa  131  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0364  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.76 
 
 
217 aa  130  1e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.36 
 
 
224 aa  130  1e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3007  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.87 
 
 
213 aa  129  2e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  39.7 
 
 
490 aa  130  2e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0604  thiamine-phosphate diphosphorylase  44.51 
 
 
217 aa  130  2e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0199515  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.83 
 
 
219 aa  129  2e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.83 
 
 
219 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.88 
 
 
343 aa  129  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.59 
 
 
203 aa  129  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.69 
 
 
205 aa  129  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.38 
 
 
204 aa  128  5e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0492  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.23 
 
 
206 aa  128  7e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1543  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.92 
 
 
207 aa  127  8e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0451009  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.1 
 
 
205 aa  127  1e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.40521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.3 
 
 
219 aa  127  1e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.91 
 
 
219 aa  127  1e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.97058e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.46 
 
 
223 aa  127  2e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>