More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1344 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  100 
 
 
218 aa  452  1e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  58.96 
 
 
219 aa  249  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  54.42 
 
 
216 aa  241  7e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  52.47 
 
 
229 aa  214  7e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  53.95 
 
 
214 aa  205  4e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  47 
 
 
219 aa  197  9e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  44.6 
 
 
218 aa  180  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  42.72 
 
 
218 aa  158  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  37.56 
 
 
209 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  41.06 
 
 
203 aa  153  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  41.46 
 
 
210 aa  152  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  42.57 
 
 
215 aa  150  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  38.05 
 
 
209 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  8.51252e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  38.54 
 
 
208 aa  148  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  38.54 
 
 
204 aa  145  7e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.43474e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4039  methyltransferase type 12  41.23 
 
 
209 aa  144  8e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2544  methyltransferase type 12  38.46 
 
 
200 aa  141  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  38.73 
 
 
199 aa  131  1e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  35.1 
 
 
207 aa  119  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1449  methyltransferase, putative  34.78 
 
 
201 aa  105  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02405  methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14390)  30.6 
 
 
258 aa  91.3  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1469  Methyltransferase type 12  30.11 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1649  Methyltransferase type 12  30.1 
 
 
200 aa  85.5  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.70723e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  32.81 
 
 
206 aa  75.9  4e-13  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  29.32 
 
 
206 aa  74.7  1e-12  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
309 aa  73.9  2e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  30.73 
 
 
306 aa  73.6  2e-12  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.16904e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.19 
 
 
207 aa  70.1  2e-11  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 
259 aa  70.1  3e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  28.65 
 
 
305 aa  69.3  4e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  35.24 
 
 
254 aa  69.3  4e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
327 aa  69.3  4e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  35.24 
 
 
254 aa  69.3  4e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  35.24 
 
 
254 aa  69.3  5e-11  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.24 
 
 
254 aa  68.9  5e-11  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  35.04 
 
 
258 aa  67.8  1e-10  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  23.72 
 
 
207 aa  68.2  1e-10  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
349 aa  67.8  1e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  30.05 
 
 
307 aa  67.8  1e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  30.95 
 
 
265 aa  67.8  1e-10  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 
250 aa  67.4  2e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 
259 aa  67.4  2e-10  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  27.65 
 
 
335 aa  67.4  2e-10  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  29.89 
 
 
312 aa  67.4  2e-10  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  26.01 
 
 
339 aa  66.2  3e-10  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  32.04 
 
 
259 aa  65.9  4e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.75 
 
 
255 aa  65.9  5e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  29.05 
 
 
250 aa  65.9  5e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  28.81 
 
 
329 aa  65.9  5e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
250 aa  65.5  6e-10  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  31.53 
 
 
253 aa  65.5  6e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
349 aa  65.5  6e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  26.67 
 
 
354 aa  65.1  7e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  29.23 
 
 
265 aa  65.1  8e-10  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  26.11 
 
 
342 aa  65.1  8e-10  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 
268 aa  64.3  1e-09  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
333 aa  64.3  1e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  25.43 
 
 
328 aa  64.3  1e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.63 
 
 
250 aa  64.7  1e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  28 
 
 
250 aa  64.7  1e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
250 aa  64.7  1e-09  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  28 
 
 
250 aa  64.7  1e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  26.71 
 
 
250 aa  63.5  2e-09  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  28.26 
 
 
197 aa  63.9  2e-09  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  28 
 
 
250 aa  63.9  2e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  26.34 
 
 
305 aa  63.5  2e-09  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
337 aa  63.2  3e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.74 
 
 
254 aa  63.5  3e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  27.74 
 
 
254 aa  63.5  3e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
208 aa  62.8  4e-09  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  27.5 
 
 
256 aa  62  7e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  5.01952e-05 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.19 
 
 
244 aa  61.6  8e-09  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
334 aa  61.6  8e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  31.79 
 
 
326 aa  61.6  9e-09  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  29.19 
 
 
239 aa  61.6  9e-09  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  32.37 
 
 
326 aa  61.2  1e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  32.65 
 
 
210 aa  61.2  1e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  27.57 
 
 
212 aa  61.6  1e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.4 
 
 
402 aa  61.2  1e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  7.41696e-11 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 
253 aa  61.2  1e-08  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 
250 aa  60.5  2e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  33.98 
 
 
256 aa  60.8  2e-08  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  30.12 
 
 
239 aa  60.1  2e-08  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
304 aa  60.1  2e-08  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34303  predicted protein  29.19 
 
 
252 aa  60.1  2e-08  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.294482  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  36.45 
 
 
402 aa  60.5  2e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 
250 aa  60.5  2e-08  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  32.11 
 
 
261 aa  60.5  2e-08  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  30.37 
 
 
264 aa  60.1  2e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  25.15 
 
 
250 aa  60.5  2e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  26.59 
 
 
307 aa  60.1  3e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4583  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
220 aa  60.1  3e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.130075 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  28.41 
 
 
341 aa  59.7  3e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  27.32 
 
 
194 aa  59.3  4e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  27.53 
 
 
340 aa  59.7  4e-08  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 
244 aa  58.9  5e-08  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  28.09 
 
 
341 aa  59.3  5e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  32.48 
 
 
270 aa  58.9  6e-08  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
337 aa  58.9  6e-08  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  30.41 
 
 
268 aa  58.5  7e-08  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>