15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1334 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1334  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  317  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.355353  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0683  hypothetical protein  67.08 
 
 		 159 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00218027  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2487  hypothetical protein  58.75 
 
 		 160 aa  197  7e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274795  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1002  hypothetical protein  58.13 
 
 		 154 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1149  hypothetical protein  66.39 
 
 		 178 aa  174  5e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000392175  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2242  hypothetical protein  64.29 
 
 		 148 aa  170  9e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.85099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2491  hypothetical protein  68.03 
 
 		 150 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.548043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00099  hypothetical protein  43.85 
 
 		 148 aa  104  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1418  hypothetical protein  36.84 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0375  hypothetical protein  38.64 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2148  hypothetical protein  43.1 
 
 		 144 aa  87.4  7e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.511349  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1846  hypothetical protein  38.66 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1462  hypothetical protein  31.9 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0573227 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1055  hypothetical protein  25.22 
 
 		 145 aa  51.6  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1186  hypothetical protein  20.33 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110214  decreased coverage  0.000713842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>