More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1326 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 398 aa  788    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0997151  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  73.3 
 
 		 398 aa  533  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0871  secretion protein HlyD  62.97 
 
 		 406 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75327  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1045  RND family efflux transporter MFP subunit  54.73 
 
 		 397 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1361  RND efflux membrane protein  51.15 
 
 		 383 aa  383  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1685  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.15 
 
 		 383 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2877  secretion protein HlyD  53.96 
 
 		 383 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1834  RND family efflux transporter MFP subunit  51.15 
 
 		 383 aa  376  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.41663  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1919  RND family efflux transporter MFP subunit  51.54 
 
 		 383 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3834  RND family efflux transporter MFP subunit  51.54 
 
 		 383 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3851  RND family efflux transporter MFP subunit  51.54 
 
 		 383 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2685  RND family efflux transporter MFP subunit  50.77 
 
 		 383 aa  368  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.133522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.25 
 
 		 378 aa  365  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0357289  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1251  RND family efflux transporter MFP subunit  50.51 
 
 		 383 aa  363  4e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0652431  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.72 
 
 		 384 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0145  RND family efflux transporter MFP subunit  46.8 
 
 		 383 aa  332  8e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2837  RND family efflux transporter MFP subunit  46.59 
 
 		 406 aa  319  5e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025637 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1925  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.31 
 
 		 396 aa  318  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.588537  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1184  secretion protein HlyD  45.24 
 
 		 396 aa  309  5e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3253  RND family efflux transporter MFP subunit  48.64 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1673  secretion protein HlyD  41.43 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.801945 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3623  secretion protein HlyD  44.41 
 
 		 398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0728465  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.58 
 
 		 347 aa  159  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  31.96 
 
 		 389 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.31 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  33.14 
 
 		 390 aa  152  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  27.32 
 
 		 389 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3303  RND family efflux transporter MFP subunit  30.64 
 
 		 418 aa  129  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3496  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3301  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.446472 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1362  secretion protein HlyD  27.98 
 
 		 381 aa  110  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.27807  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  26.68 
 
 		 431 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.96 
 
 		 357 aa  103  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.036609  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0382  RND family efflux transporter MFP subunit  26.61 
 
 		 396 aa  103  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.410142  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1309  efflux protein  29.04 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  29.05 
 
 		 358 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  28.41 
 
 		 408 aa  97.4  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  27.83 
 
 		 408 aa  94.4  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  28.49 
 
 		 368 aa  93.6  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  27.89 
 
 		 418 aa  91.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  28.72 
 
 		 404 aa  90.1  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3476  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.25 
 
 		 382 aa  89.7  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1452  RND family efflux transporter MFP subunit  25.34 
 
 		 369 aa  89.7  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2781  RND family efflux transporter MFP subunit  31 
 
 		 364 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.1 
 
 		 407 aa  89.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  29.07 
 
 		 367 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  28.78 
 
 		 367 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  26.91 
 
 		 407 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  27.25 
 
 		 384 aa  87.4  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  27.76 
 
 		 415 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1870  secretion protein HlyD  27.55 
 
 		 427 aa  87  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.42 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.08 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.76 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  24.07 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  24.07 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  30.06 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  26.41 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5088  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.3 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857117  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  24.07 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2754  RND efflux transporter  25.19 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.81 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1423  RND family efflux transporter MFP subunit  25.19 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5856  secretion protein HlyD  25.68 
 
 		 425 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249167  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.63 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  25.86 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.67 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000959286  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  25.69 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  27.18 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  26.38 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  24.81 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  26.17 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  25.62 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  25.82 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  26.42 
 
 		 451 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.02 
 
 		 352 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  25.88 
 
 		 409 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.05 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  27.25 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1312  RND efflux transporter  24.94 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130358  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2871  hypothetical protein  25.87 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.51 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0950  secretion protein HlyD  26.89 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.57805  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3410  secretion protein HlyD  27.89 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.795724  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5368  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.82 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0514804  normal  0.515508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33770  hypothetical protein  25.87 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127582  hitchhiker  0.00383681 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3523  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.61 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51854  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3197  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.69 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.822347  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  27.03 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  23.82 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1983  RND family efflux transporter MFP subunit  29.01 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.49 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  22.94 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  25.13 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.14 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  28.45 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  25.21 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  25.69 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  23.99 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0393  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  25.13 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>