More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1310 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1310  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  100 
 
 
760 aa  1554    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.831791  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.72 
 
 
804 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.327511  hitchhiker  0.00549488 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1205  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  85.13 
 
 
770 aa  1314    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.737255  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.87 
 
 
739 aa  700    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2274  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  54.17 
 
 
754 aa  771    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00429114  normal  0.210249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3970  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.72 
 
 
724 aa  654    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0281  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.87 
 
 
739 aa  700    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0266  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.87 
 
 
739 aa  698    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.01 
 
 
739 aa  701    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0397  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.81 
 
 
744 aa  671    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  58.93 
 
 
758 aa  853    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3742  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.77 
 
 
767 aa  670    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182155 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  77.11 
 
 
758 aa  1204    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0005  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.36 
 
 
737 aa  636    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0508779 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.9 
 
 
777 aa  682    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.72 
 
 
739 aa  696    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22130  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.56 
 
 
733 aa  699    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.759305  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1015  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.6 
 
 
736 aa  640    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1089  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  82.89 
 
 
761 aa  1289    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.550447  normal  0.288584 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1019  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  80.16 
 
 
761 aa  1256    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4321  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.72 
 
 
764 aa  674    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0294  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.87 
 
 
739 aa  700    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.1 
 
 
777 aa  673    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.400519  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2048  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.16 
 
 
733 aa  721    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4214  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.89 
 
 
759 aa  682    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317587  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1449  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.2 
 
 
730 aa  639    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2256  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.01 
 
 
719 aa  638    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0275  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.15 
 
 
739 aa  701    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.87 
 
 
739 aa  700    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.76 
 
 
742 aa  730    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  54 
 
 
741 aa  757    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.09 
 
 
768 aa  688    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409731  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3688  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.19 
 
 
767 aa  665    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2197  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.98 
 
 
747 aa  646    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.541923 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4369  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.96 
 
 
759 aa  678    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.65 
 
 
733 aa  736    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2596  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.07 
 
 
775 aa  664    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0513067 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3394  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.36 
 
 
802 aa  655    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4346  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.61 
 
 
759 aa  687    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.04 
 
 
739 aa  657    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  78.82 
 
 
761 aa  1224    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.6 
 
 
742 aa  727    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.59 
 
 
739 aa  700    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1265  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  83.68 
 
 
760 aa  1301    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.377491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1663  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  54.72 
 
 
750 aa  763    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.87 
 
 
739 aa  700    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.72 
 
 
739 aa  695    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3587  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.68 
 
 
782 aa  672    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.565249 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4362  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50 
 
 
767 aa  681    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516732  normal  0.595476 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.3 
 
 
779 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3840  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.48 
 
 
761 aa  632  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.619159  normal  0.165254 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.5 
 
 
779 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2586  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.71 
 
 
739 aa  633  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.236603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0008  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.76 
 
 
737 aa  634  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70389  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.67 
 
 
803 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.07 
 
 
779 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.82 
 
 
766 aa  631  1e-179  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1184  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.24 
 
 
735 aa  630  1e-179  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2665  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.29 
 
 
727 aa  631  1e-179  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.367188  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1330  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.53 
 
 
803 aa  628  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.26 
 
 
740 aa  626  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  48.25 
 
 
727 aa  627  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1450  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.29 
 
 
733 aa  624  1e-177  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244925  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.73 
 
 
768 aa  624  1e-177  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.85 
 
 
779 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.494756  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5401  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.49 
 
 
735 aa  624  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.33 
 
 
794 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0064  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.68 
 
 
746 aa  620  1e-176  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250893  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1277  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.56 
 
 
744 aa  620  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0140  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.63 
 
 
742 aa  617  1e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1027  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.43 
 
 
741 aa  615  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.352422 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0863  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.51 
 
 
737 aa  617  1e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.472862  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.37 
 
 
749 aa  613  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919609  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.52 
 
 
736 aa  613  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1133  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.05 
 
 
741 aa  615  9.999999999999999e-175  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0837  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.94 
 
 
740 aa  610  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41714  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.94 
 
 
740 aa  610  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2389  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.09 
 
 
740 aa  607  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.07 
 
 
737 aa  607  9.999999999999999e-173  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.56 
 
 
745 aa  606  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334918  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1127  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.37 
 
 
741 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0654  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.29 
 
 
729 aa  604  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1151  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.47 
 
 
729 aa  604  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0723  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.05 
 
 
738 aa  603  1.0000000000000001e-171  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1129  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.47 
 
 
729 aa  604  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1934  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.16 
 
 
743 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1752  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.13 
 
 
736 aa  601  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0012  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.43 
 
 
741 aa  599  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160482  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2144  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.56 
 
 
744 aa  601  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.470328  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0011  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.3 
 
 
741 aa  598  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.21 
 
 
723 aa  598  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0229678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0010  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.51 
 
 
741 aa  595  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0978  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.82 
 
 
728 aa  592  1e-168  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.74135  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1035  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.95 
 
 
728 aa  593  1e-168  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.57 
 
 
736 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.755949  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0185  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.38 
 
 
737 aa  593  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.310724 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0028  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.65 
 
 
752 aa  590  1e-167  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2298  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.92 
 
 
734 aa  589  1e-167  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.032092 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.97 
 
 
744 aa  591  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1596  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.52 
 
 
740 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.122735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>