More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1300 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  54.74 
 
 
1328 aa  643  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
771 aa  1544  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.03 
 
 
885 aa  667  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.12 
 
 
787 aa  764  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  47.19 
 
 
1507 aa  617  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  52.08 
 
 
1215 aa  582  1e-164  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  51.82 
 
 
1424 aa  558  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  41.79 
 
 
799 aa  468  1e-130  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  40.93 
 
 
1044 aa  432  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  54.68 
 
 
454 aa  432  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  45.24 
 
 
1105 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  1.82587e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  48.94 
 
 
924 aa  403  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  38.41 
 
 
725 aa  400  1e-110  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  33.48 
 
 
2145 aa  395  1e-108  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  48.66 
 
 
1039 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  37.54 
 
 
1288 aa  376  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  32.61 
 
 
1050 aa  376  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.96 
 
 
767 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.8 
 
 
1186 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  51.6 
 
 
911 aa  359  1e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  53.44 
 
 
568 aa  322  2e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  53.44 
 
 
568 aa  322  2e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  53.5 
 
 
444 aa  320  7e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  46.15 
 
 
843 aa  320  8e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.54 
 
 
991 aa  305  2e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  35.62 
 
 
1488 aa  305  2e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  28.13 
 
 
1040 aa  298  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  33.47 
 
 
1262 aa  289  1e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  55.43 
 
 
751 aa  287  5e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  49.1 
 
 
825 aa  287  5e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  46.86 
 
 
919 aa  283  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  50.5 
 
 
362 aa  279  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  37.59 
 
 
822 aa  268  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  32.95 
 
 
1185 aa  260  5e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  39.57 
 
 
1131 aa  255  2e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  32.19 
 
 
1550 aa  254  4e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  52.83 
 
 
311 aa  250  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  45.56 
 
 
672 aa  243  9e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  33.18 
 
 
953 aa  243  9e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 
443 aa  242  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  33.98 
 
 
1128 aa  238  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  40.65 
 
 
493 aa  238  5e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  50.2 
 
 
284 aa  235  2e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  42.91 
 
 
977 aa  231  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  33.69 
 
 
1290 aa  227  5e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  41.44 
 
 
814 aa  220  8e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  52.46 
 
 
785 aa  218  3e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  52.29 
 
 
481 aa  217  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  46.12 
 
 
680 aa  216  2e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  37.16 
 
 
669 aa  214  6e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  54.55 
 
 
212 aa  214  6e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  36.32 
 
 
732 aa  212  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  32.64 
 
 
1056 aa  202  2e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  32.38 
 
 
1125 aa  202  2e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  28.09 
 
 
1404 aa  195  2e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  26.26 
 
 
694 aa  196  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.97 
 
 
667 aa  196  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  35.46 
 
 
1028 aa  191  3e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 
1283 aa  191  4e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  56.42 
 
 
190 aa  189  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  33.85 
 
 
919 aa  185  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  28.28 
 
 
1475 aa  185  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
1088 aa  179  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  25.85 
 
 
740 aa  178  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  29.11 
 
 
828 aa  177  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  27.86 
 
 
708 aa  172  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.76 
 
 
968 aa  172  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  25.52 
 
 
782 aa  167  6e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 
776 aa  166  1e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  27.57 
 
 
1068 aa  166  1e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 
949 aa  164  5e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  33.43 
 
 
469 aa  160  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 
1313 aa  159  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  34.67 
 
 
1228 aa  151  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  35.62 
 
 
963 aa  150  1e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 
1261 aa  149  2e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 
966 aa  149  2e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 
937 aa  148  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 
837 aa  148  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.65 
 
 
810 aa  149  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  34.01 
 
 
577 aa  147  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  23.41 
 
 
836 aa  147  6e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 
878 aa  147  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  34.23 
 
 
1212 aa  146  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  28.79 
 
 
1136 aa  139  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 
857 aa  138  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.65 
 
 
854 aa  137  7e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  29.81 
 
 
1146 aa  137  1e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 
1365 aa  135  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  26.29 
 
 
1611 aa  135  4e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  36.59 
 
 
304 aa  134  7e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 
1596 aa  132  2e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  28.31 
 
 
686 aa  132  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  24.56 
 
 
2327 aa  131  5e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 
1054 aa  129  1e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  26.55 
 
 
1238 aa  130  1e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  24.32 
 
 
1180 aa  129  2e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1716  TPR repeat-containing protein  45.83 
 
 
162 aa  128  4e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  28.97 
 
 
1106 aa  127  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  28.22 
 
 
1429 aa  126  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>