61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1260 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  511  1e-144  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0766  hypothetical protein  51.22 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00180926  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  32.14 
 
 		 630 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1496  hypothetical protein  45.67 
 
 		 353 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0908  hypothetical protein  48.41 
 
 		 174 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000542792  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2170  hypothetical protein  93.22 
 
 		 59 aa  116  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  24.24 
 
 		 926 aa  109  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0232  hypothetical protein  44.63 
 
 		 189 aa  106  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.12225  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  23.7 
 
 		 423 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1431  hypothetical protein  45 
 
 		 145 aa  103  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1035  hypothetical protein  42.98 
 
 		 177 aa  103  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1359  hypothetical protein  42.86 
 
 		 182 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0526065  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1497  hypothetical protein  40.99 
 
 		 170 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.844823  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1040  hypothetical protein  41.13 
 
 		 174 aa  95.5  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194155  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1095  hypothetical protein  46.23 
 
 		 171 aa  95.5  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152193  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  27.48 
 
 		 489 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  38.54 
 
 		 928 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1442  hypothetical protein  30.98 
 
 		 265 aa  85.5  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.658193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1038  hypothetical protein  41.46 
 
 		 135 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  26.67 
 
 		 484 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  30.99 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2496  hypothetical protein  27.59 
 
 		 188 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000377569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3170  hypothetical protein  31.03 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3298  flagellar hook-length control protein  27.94 
 
 		 602 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2263  hypothetical protein  28.63 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000459083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0953  hypothetical protein  34.53 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.585982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1092  hypothetical protein  31.86 
 
 		 180 aa  62  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3294  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157417  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  28.57 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  30 
 
 		 1161 aa  59.3  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1752  hypothetical protein  37.35 
 
 		 173 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000963449  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3620  hypothetical protein  26.4 
 
 		 184 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.794068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0384  hypothetical protein  34.44 
 
 		 202 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  33.33 
 
 		 522 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1247  hypothetical protein  27.78 
 
 		 188 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1573  hypothetical protein  21.82 
 
 		 1197 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.275879  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3095  hypothetical protein  31.78 
 
 		 214 aa  53.1  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1180  hypothetical protein  31.62 
 
 		 232 aa  53.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1763  hypothetical protein  30.67 
 
 		 183 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.4783800000000001e-18  normal  0.040844 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30685  predicted protein  31.76 
 
 		 1362 aa  50.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.761238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0782  hypothetical protein  37.74 
 
 		 177 aa  50.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.674637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0854  hypothetical protein  46.67 
 
 		 500 aa  48.9  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.939833 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51761  predicted protein  32.71 
 
 		 136 aa  48.9  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935673  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2054  hypothetical protein  25.26 
 
 		 329 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3394  hypothetical protein  24.21 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4281  cell surface protein  41.77 
 
 		 953 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.533345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  21.01 
 
 		 3472 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3444  hypothetical protein  22.77 
 
 		 313 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000353163  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  21.01 
 
 		 3471 aa  46.2  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3436  hypothetical protein  25.24 
 
 		 283 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8424  protein of unknown function DUF470  27.27 
 
 		 701 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  19.46 
 
 		 3521 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  39.47 
 
 		 1079 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  28.26 
 
 		 1000 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0935  hypothetical protein  28.28 
 
 		 192 aa  42.7  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.879201  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  37.14 
 
 		 2272 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1053  hypothetical protein  28.28 
 
 		 192 aa  42.7  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.308187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0293  hypothetical protein  25.71 
 
 		 328 aa  42.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000169852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  22.06 
 
 		 3409 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4394  helicase domain-containing protein  47.73 
 
 		 1140 aa  42  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23510  hypothetical protein  44.86 
 
 		 1465 aa  42.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  unclonable  0.00000499426  normal  0.846477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>