More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1234 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
265 aa  551  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  93.89 
 
 
262 aa  512  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1031  protein of unknown function DUF323  90.19 
 
 
265 aa  503  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1321  protein of unknown function DUF323  80.68 
 
 
270 aa  435  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.329702  hitchhiker  0.00614552 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2231  hypothetical protein  94.5 
 
 
153 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1045  hypothetical protein  94.39 
 
 
134 aa  217  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2245  hypothetical protein  90.83 
 
 
118 aa  210  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2255  hypothetical protein  91.57 
 
 
87 aa  149  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  37.98 
 
 
303 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  35.71 
 
 
253 aa  129  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1994  hypothetical protein  36.61 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  38.4 
 
 
621 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  36.65 
 
 
263 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  37.04 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0185  transcriptional regulator, XRE family  39.15 
 
 
311 aa  118  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  38.59 
 
 
417 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  33.72 
 
 
766 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  35.85 
 
 
861 aa  112  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  33.2 
 
 
412 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  40.82 
 
 
442 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  34.36 
 
 
439 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  41.84 
 
 
444 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  30.32 
 
 
338 aa  109  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  38.86 
 
 
437 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  32.69 
 
 
312 aa  109  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  36.55 
 
 
291 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  30.45 
 
 
331 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  33.57 
 
 
301 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  34.53 
 
 
303 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.61 
 
 
303 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0142  hypothetical protein  33.67 
 
 
633 aa  102  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0534916  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 
349 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  39.66 
 
 
1818 aa  102  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  31.15 
 
 
614 aa  101  1e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.91 
 
 
367 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  39.8 
 
 
444 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  33.68 
 
 
433 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.57 
 
 
308 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0142  protein of unknown function DUF323  33.17 
 
 
456 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.741056  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  34.43 
 
 
506 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  39.09 
 
 
447 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  40.72 
 
 
442 aa  99  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  39.69 
 
 
437 aa  99  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  33.96 
 
 
487 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  31.54 
 
 
1186 aa  98.2  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 
351 aa  97.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  29.69 
 
 
358 aa  95.9  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
416 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  31.25 
 
 
416 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  31.03 
 
 
384 aa  95.9  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  31.3 
 
 
324 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  31.3 
 
 
334 aa  95.5  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  32.86 
 
 
277 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  29.45 
 
 
923 aa  95.1  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  29.83 
 
 
409 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  31.21 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  34.07 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  29.21 
 
 
325 aa  93.6  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  27.27 
 
 
802 aa  93.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  29 
 
 
273 aa  93.6  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  33.33 
 
 
319 aa  93.6  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  30.96 
 
 
316 aa  93.6  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  30.89 
 
 
408 aa  92.8  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  32.52 
 
 
307 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  31.98 
 
 
421 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  31.98 
 
 
377 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  29.78 
 
 
517 aa  92.4  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  30.16 
 
 
390 aa  92.4  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  38.58 
 
 
468 aa  92.4  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  30.71 
 
 
267 aa  92  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  32.45 
 
 
436 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  32.45 
 
 
436 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  32.45 
 
 
436 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  29.03 
 
 
820 aa  90.5  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.32 
 
 
554 aa  90.1  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  33.48 
 
 
332 aa  90.1  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  30.07 
 
 
377 aa  89.4  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  28.47 
 
 
330 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  34.41 
 
 
319 aa  89.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  29.02 
 
 
1581 aa  89.4  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  30.23 
 
 
390 aa  89  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  31.85 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  32.79 
 
 
327 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  38.67 
 
 
842 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  28.8 
 
 
358 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  28.79 
 
 
436 aa  86.7  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  28.24 
 
 
1049 aa  86.7  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1282  serine/threonine kinase  38.22 
 
 
327 aa  86.3  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0376412  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  27.97 
 
 
384 aa  86.3  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  33.74 
 
 
413 aa  85.9  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  32.89 
 
 
330 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  29.25 
 
 
295 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  32.37 
 
 
481 aa  85.5  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  30.9 
 
 
1200 aa  85.5  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  27.34 
 
 
510 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  29.96 
 
 
751 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  32.93 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  28.21 
 
 
433 aa  85.1  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  31.35 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  27.91 
 
 
586 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>