190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1230 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1230  Na/Pi-cotransporter II-related protein  100 
 
 
564 aa  1116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1146  Na/Pi cotransporter II-related  61.99 
 
 
555 aa  678  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1000  Na+/Picotransporter  58.98 
 
 
559 aa  632  1e-180  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1114  Na+/Pi-cotransporter  57.19 
 
 
566 aa  593  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2381  Na/Pi-cotransporter II-related protein  44.21 
 
 
643 aa  476  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0850551  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2438  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.92 
 
 
636 aa  350  3e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1817  Na/Pi cotransporter II-related  36.89 
 
 
535 aa  311  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2868  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.56 
 
 
536 aa  303  5e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.3552e-09  decreased coverage  7.84363e-14 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.44 
 
 
566 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  5.11336e-08  hitchhiker  0.000255335 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2677  Na/Pi-cotransporter family protein/PhoU family protein  33.03 
 
 
537 aa  285  2e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.227034  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21650  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34 
 
 
548 aa  284  3e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.14807e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0064  Na+/Pi-cotransporter  34.91 
 
 
586 aa  281  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2362  putative transporter  33.03 
 
 
537 aa  280  5e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000947639  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1525  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.31 
 
 
541 aa  278  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0908  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.01 
 
 
541 aa  275  1e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1692  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.21 
 
 
541 aa  274  3e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0220  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.52 
 
 
541 aa  273  5e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.759835  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1581  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.5 
 
 
576 aa  270  6e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00393232  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.34 
 
 
567 aa  269  8e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0272264  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0479  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.73 
 
 
538 aa  262  1e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0057  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.72 
 
 
549 aa  259  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0512585  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1685  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.6 
 
 
563 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00916616  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2560  Na+/phosphate symporter  35.02 
 
 
557 aa  258  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.46827e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1565  Na+/phosphate symporter  35.55 
 
 
562 aa  255  1e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.97225e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0949  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.9 
 
 
587 aa  255  1e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  5.06684e-05 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0173  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.67 
 
 
559 aa  252  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00842075  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1777  Na/Pi cotransporter II-related  35.79 
 
 
600 aa  250  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790059  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0649  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.95 
 
 
551 aa  247  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  1.07719e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4496  Na/Pi-cotransporter family protein  32.07 
 
 
551 aa  246  6e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.04541e-08  decreased coverage  5.21204e-15 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0878  Na/Pi-cotransporter family protein  31.71 
 
 
544 aa  245  1e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  2.42556e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0880  Na/Pi-cotransporter family protein  31.53 
 
 
551 aa  245  1e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17253e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0785  Na/Pi-cotransporter family protein  31.35 
 
 
551 aa  245  2e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  4.37184e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0748  Na/Pi-cotransporter family protein  31.35 
 
 
551 aa  245  2e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000512565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0948  Na/Pi-cotransporter family protein  31.53 
 
 
551 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.88119e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0696  sodium-dependent phosphate transporter  31.35 
 
 
551 aa  244  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.23681e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0840  Na/Pi-cotransporter family protein  31.35 
 
 
551 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0001183  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0683  sodium-dependent phosphate transporter  31.35 
 
 
551 aa  240  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  2.53455e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1501  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.79 
 
 
539 aa  241  4e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1378  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.07 
 
 
556 aa  240  6e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  1.90084e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0213  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.84 
 
 
556 aa  236  1e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.550042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0696  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.53 
 
 
551 aa  234  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  3.10197e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0092  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.15 
 
 
555 aa  233  9e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0096  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.15 
 
 
555 aa  233  9e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1264  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.89 
 
 
558 aa  231  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2768  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.34 
 
 
554 aa  227  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0560713  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1672  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.28 
 
 
565 aa  224  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0476  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.98 
 
 
586 aa  216  8e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.72 
 
 
556 aa  207  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.35688e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2825  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.12 
 
 
590 aa  207  4e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1964  Na/Pi cotransporter family protein  29.93 
 
 
549 aa  206  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0384017  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2138  Na+/Pi-cotransporter  31.03 
 
 
561 aa  205  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0273638  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2810  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.46 
 
 
584 aa  204  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1734  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.6 
 
 
564 aa  202  1e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  1.08248e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1044  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.04 
 
 
574 aa  199  1e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.53118 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1191  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.1 
 
 
570 aa  198  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0079  Na+/Pi-cotransporter  30.7 
 
 
592 aa  194  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1012  Na+/Pi-cotransporter  35.03 
 
 
308 aa  193  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0064  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.3 
 
 
318 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2155  Na+/Picotransporter  32.45 
 
 
557 aa  191  3e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4094  Na/Pi-cotransporter II-related protein  39.74 
 
 
304 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.890798  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1406  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  27.36 
 
 
548 aa  179  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677902  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2061  Na+/Picotransporter  34.36 
 
 
557 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.803525  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1829  Na+/Pi-cotransporter  30.56 
 
 
543 aa  172  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2073  Na/Pi cotransporter II-related  27.29 
 
 
563 aa  169  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3921  putative Na+/phosphate transporter  26.76 
 
 
565 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146511  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3965  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  28.37 
 
 
547 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.162548  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0365  Na/Pi cotransporter II-related  27.57 
 
 
563 aa  169  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1742  Na/Pi-cotransporter family protein  28.79 
 
 
543 aa  167  3e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.160539  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4873  Na+cotransporter  26.4 
 
 
557 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00339774  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.42 
 
 
311 aa  167  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.138748  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3231  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.36 
 
 
552 aa  166  1e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2431  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.88 
 
 
310 aa  159  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  8.16248e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2737  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.75 
 
 
556 aa  157  5e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.751665  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3401  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.75 
 
 
556 aa  157  5e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161334  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0312  Na/Pi cotransporter II-related  28.49 
 
 
558 aa  157  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1876  Na+/Pi-cotransporter  35.23 
 
 
289 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00688097  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1104  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.6 
 
 
559 aa  154  3e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4483  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  24.95 
 
 
549 aa  154  3e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844603  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3461  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.1 
 
 
576 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5386  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.21 
 
 
577 aa  151  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.626198  normal  0.600286 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0816  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  27.53 
 
 
542 aa  148  2e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.568995  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2859  Na+/H+ antiporter  32.13 
 
 
554 aa  148  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.239008 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0455  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.27 
 
 
565 aa  148  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4223  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.69 
 
 
562 aa  148  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1871  Na/Pi cotransporter II-related  26.67 
 
 
548 aa  148  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860374  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9037  hypothetical protein  25.44 
 
 
561 aa  147  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0751  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  27.88 
 
 
570 aa  147  7e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0476826  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1430  Na/Pi cotransporter II-related  26.65 
 
 
548 aa  146  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0161  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  26.1 
 
 
552 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4758  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.51 
 
 
601 aa  145  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554336  normal  0.516218 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1792  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.45 
 
 
553 aa  144  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0199  Na+/Picotransporter  35.35 
 
 
303 aa  144  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3948  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  24.85 
 
 
548 aa  144  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00173095  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3663  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.97 
 
 
535 aa  141  4e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0461  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  26.5 
 
 
548 aa  140  5e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3770  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  24.9 
 
 
548 aa  140  5e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0163  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  25.74 
 
 
552 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0141  Na+/Pi-cotransporter  25.63 
 
 
556 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3048  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  26.87 
 
 
548 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5082  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  25.55 
 
 
552 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0387022 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>