More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1222 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 331 aa  677    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  60.09 
 
 		 441 aa  472  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  44.29 
 
 		 357 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  38.75 
 
 		 412 aa  89.4  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  51.26 
 
 		 1033 aa  86.7  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  53 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0951  pentapeptide repeat protein  42.64 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  41.26 
 
 		 343 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  41.26 
 
 		 343 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  52.88 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1853  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 369 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  41.22 
 
 		 446 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  45.65 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  45.63 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  57.83 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  52.08 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  46.49 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  58.06 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  45.16 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  43.65 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  45.16 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  37.99 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  36.73 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  42.03 
 
 		 576 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  55.17 
 
 		 250 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  42.15 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  34.39 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  58.75 
 
 		 517 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  36.05 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  46.53 
 
 		 900 aa  77  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  56.47 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  58.02 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50.93 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  42.02 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  53.93 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  45.54 
 
 		 525 aa  76.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  34.81 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0870  pentapeptide repeat protein  40.87 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  50.47 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  50.47 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  46.09 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  40.43 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  59.74 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  56.18 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  45 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  59.74 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  44.55 
 
 		 234 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  39.84 
 
 		 206 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  44.92 
 
 		 199 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  47.79 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  47.57 
 
 		 182 aa  75.1  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  45.05 
 
 		 521 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  49 
 
 		 194 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1987  pentapeptide repeat-containing protein  53.49 
 
 		 146 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  47.73 
 
 		 514 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  52.38 
 
 		 745 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  48.48 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  49.02 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  54.65 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  35.23 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  48.62 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  55.17 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  47.31 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  49.48 
 
 		 493 aa  73.6  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0112  heat shock protein DnaJ domain protein  44.54 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  48.18 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0108  heat shock protein DnaJ domain protein  44.54 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  35.23 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  45.13 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  55.91 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  53.25 
 
 		 830 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  48.51 
 
 		 489 aa  72.8  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  45.61 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 222 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  51.81 
 
 		 142 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  36.21 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  55.56 
 
 		 165 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7498  pentapeptide repeat protein  43.7 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  50.53 
 
 		 973 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  45.05 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  48.18 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  48.15 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  48.18 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  35.9 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  53.85 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  50.51 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  53.85 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  48.39 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  52.22 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  46.67 
 
 		 1191 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  35.4 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  46.34 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  40.95 
 
 		 438 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  40.65 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  44.14 
 
 		 567 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  43.8 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  61.19 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  47.73 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  51.95 
 
 		 830 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  41.78 
 
 		 776 aa  70.5  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>