More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1220 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 441 aa  901    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  75.99 
 
 		 331 aa  468  9.999999999999999e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  44.28 
 
 		 357 aa  243  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  47.91 
 
 		 449 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  43.11 
 
 		 343 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  43.11 
 
 		 343 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  40.42 
 
 		 309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  45.92 
 
 		 493 aa  126  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  41.99 
 
 		 489 aa  126  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  43 
 
 		 576 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  35.9 
 
 		 381 aa  124  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  40 
 
 		 567 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  43.42 
 
 		 311 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  43.28 
 
 		 776 aa  121  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  45.11 
 
 		 517 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  40.26 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  40.78 
 
 		 267 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  34.2 
 
 		 734 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  43.85 
 
 		 264 aa  116  6.9999999999999995e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  41.35 
 
 		 333 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  44.33 
 
 		 225 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  31.65 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  45.45 
 
 		 286 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  41.88 
 
 		 862 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  40.09 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  42.08 
 
 		 521 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  34.98 
 
 		 294 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  41.15 
 
 		 386 aa  113  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  36.02 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  36.78 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  41.9 
 
 		 214 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  47.09 
 
 		 1033 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  39.64 
 
 		 268 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  50.33 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  47.43 
 
 		 277 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  43.01 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  45.2 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  45.2 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  40.45 
 
 		 295 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  37.65 
 
 		 351 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  40.43 
 
 		 234 aa  106  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  35.37 
 
 		 440 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  38.28 
 
 		 291 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  38.28 
 
 		 291 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  40.1 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  36.55 
 
 		 448 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  42.35 
 
 		 216 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  35.29 
 
 		 356 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  40.21 
 
 		 233 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  40.21 
 
 		 233 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  41.97 
 
 		 745 aa  103  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  34.87 
 
 		 356 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  41.53 
 
 		 184 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  41.76 
 
 		 263 aa  103  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  38.42 
 
 		 219 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  40.31 
 
 		 213 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  33.47 
 
 		 515 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  35.58 
 
 		 312 aa  100  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  43.01 
 
 		 241 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  31.72 
 
 		 285 aa  100  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  45.95 
 
 		 245 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  35.92 
 
 		 262 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  34.51 
 
 		 262 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  39.09 
 
 		 227 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  44.2 
 
 		 278 aa  98.2  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  41.84 
 
 		 213 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  44.79 
 
 		 222 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  41.24 
 
 		 199 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  40.45 
 
 		 279 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  40.45 
 
 		 279 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  37.2 
 
 		 412 aa  97.4  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  34.67 
 
 		 432 aa  97.1  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  43.71 
 
 		 215 aa  97.1  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  39.55 
 
 		 199 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  40.29 
 
 		 266 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  41.55 
 
 		 267 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  39.81 
 
 		 218 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  42.21 
 
 		 182 aa  96.7  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  41.92 
 
 		 217 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  41.71 
 
 		 493 aa  96.3  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  36.25 
 
 		 412 aa  96.3  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  33.18 
 
 		 350 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  44.97 
 
 		 180 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  44.1 
 
 		 447 aa  95.5  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  37.17 
 
 		 300 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  37.24 
 
 		 483 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  44.17 
 
 		 222 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  38.89 
 
 		 250 aa  94.4  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  40.99 
 
 		 189 aa  94.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  37.12 
 
 		 1191 aa  94.4  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38880  hypothetical protein  41.32 
 
 		 215 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  37.57 
 
 		 412 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  43.2 
 
 		 225 aa  93.6  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  37.16 
 
 		 727 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  40.1 
 
 		 456 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  44.91 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  35.15 
 
 		 401 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  32.74 
 
 		 366 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  35.15 
 
 		 401 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  41.24 
 
 		 903 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>