More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1190 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  100 
 
 		 303 aa  631  1e-180  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  76.09 
 
 		 297 aa  491  9.999999999999999e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  77.74 
 
 		 301 aa  488  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  79.21 
 
 		 305 aa  487  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  78.22 
 
 		 303 aa  481  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  73.93 
 
 		 303 aa  482  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  72.28 
 
 		 303 aa  461  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  52.67 
 
 		 280 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  50.36 
 
 		 286 aa  278  8e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  50.36 
 
 		 276 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  48.73 
 
 		 271 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  49.1 
 
 		 277 aa  270  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  47.99 
 
 		 279 aa  266  4e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  50.18 
 
 		 285 aa  264  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  50.18 
 
 		 271 aa  263  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  50.97 
 
 		 284 aa  263  3e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  47.08 
 
 		 271 aa  261  8e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  47.48 
 
 		 281 aa  261  8.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  46.81 
 
 		 272 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  46.74 
 
 		 274 aa  258  8e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  47.92 
 
 		 285 aa  257  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  48.91 
 
 		 273 aa  257  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  47.55 
 
 		 293 aa  256  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  45.96 
 
 		 280 aa  255  8e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  46.01 
 
 		 274 aa  255  8e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  46.69 
 
 		 272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  47.46 
 
 		 689 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  47.83 
 
 		 275 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  46.49 
 
 		 273 aa  248  7e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  45.09 
 
 		 274 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  46.13 
 
 		 280 aa  246  2e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  43.73 
 
 		 277 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  44 
 
 		 275 aa  246  3e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  44.16 
 
 		 281 aa  246  3e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  44.36 
 
 		 275 aa  246  4e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  44.73 
 
 		 274 aa  246  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  44 
 
 		 275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  47.83 
 
 		 278 aa  244  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  43.77 
 
 		 273 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  44.65 
 
 		 275 aa  238  5.999999999999999e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  43.59 
 
 		 269 aa  238  6.999999999999999e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  43.38 
 
 		 282 aa  238  8e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  44.61 
 
 		 275 aa  234  9e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  42.36 
 
 		 286 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  41.79 
 
 		 281 aa  233  3e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  46.91 
 
 		 279 aa  233  4.0000000000000004e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0048  transketolase domain-containing protein  45.19 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  43.96 
 
 		 279 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  40.51 
 
 		 265 aa  215  7e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  44.77 
 
 		 309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  40.29 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  41.39 
 
 		 276 aa  208  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  39.05 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  40.82 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  40.58 
 
 		 606 aa  202  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  37.69 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  41.42 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  38.76 
 
 		 273 aa  198  7e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  40 
 
 		 280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.57 
 
 		 555 aa  195  8.000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  40.15 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  35.82 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  35.23 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  42.74 
 
 		 276 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  42.34 
 
 		 276 aa  191  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  42.34 
 
 		 276 aa  191  9e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  40 
 
 		 280 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  39.47 
 
 		 281 aa  188  9e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5276  transketolase domain-containing protein  41.83 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  36.46 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  38.55 
 
 		 281 aa  185  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  37.55 
 
 		 277 aa  185  8e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2719  transketolase subunit A  40.78 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  38.2 
 
 		 270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1540  transketolase domain-containing protein  41.3 
 
 		 282 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220485  normal  0.477158 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  37.45 
 
 		 299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  39.61 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  36.13 
 
 		 269 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  40.23 
 
 		 283 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  36.2 
 
 		 288 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  38.57 
 
 		 287 aa  179  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  38.04 
 
 		 623 aa  179  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  36.59 
 
 		 618 aa  179  4e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  39.92 
 
 		 279 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1276  Transketolase domain protein  36.43 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0728  transketolase domain-containing protein  42.4 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4990  transketolase domain-containing protein  41.13 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1461  transketolase subunit A  39.92 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  38.27 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  36.86 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4931  transketolase domain-containing protein  40.49 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  35.71 
 
 		 263 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  35.4 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3642  transketolase domain-containing protein  39.11 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0863468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2745  transketolase domain-containing protein  38.99 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498347  normal  0.112141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2614  transketolase domain-containing protein  41.56 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336925  normal  0.70131 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6423  transketolase-like  40.49 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6658  transketolase domain-containing protein  40.49 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6256  transketolase domain-containing protein  40.49 
 
 		 281 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  38.43 
 
 		 624 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>