More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1174 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1174  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  216  7e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000370902  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1171  hypothetical protein  88.29 
 
 		 111 aa  195  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000413849  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0875  hypothetical protein  86.49 
 
 		 111 aa  191  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.477769  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1190  hypothetical protein  83.78 
 
 		 111 aa  187  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0238697  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1285  hypothetical protein  82.24 
 
 		 109 aa  177  4e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.496874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0882  hypothetical protein  71.17 
 
 		 118 aa  159  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577167  normal  0.0425373 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1179  hypothetical protein  71.17 
 
 		 111 aa  159  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000863207  normal  0.0112424 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  50.52 
 
 		 104 aa  87  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  46.94 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  47.42 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  42.86 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  44.9 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  40.62 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  42 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0165  hypothetical protein  45.28 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  43 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  41.24 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  39.18 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  39.18 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  43.75 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.384172 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  41.67 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  37.37 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  44.79 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  40.2 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  40.2 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  42.42 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  41.67 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  41.05 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  38.78 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  45.74 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  45.36 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  40.62 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  40.62 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  40.62 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  40.62 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  40.62 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  40.62 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  40.62 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  40.62 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  39.58 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  40.62 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  40.62 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  40.62 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  40.62 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  44.34 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  40.62 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  40.62 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  39.18 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  43.75 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0530  hypothetical protein  45.05 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00315324  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  38.38 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  39.8 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0701  hypothetical protein  40.62 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0509  hypothetical protein  40.62 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00428727  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0645  hypothetical protein  40.62 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6386  hypothetical protein  37.5 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  39.58 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  39.58 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  39.18 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  39.18 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1400  hypothetical protein  43.48 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851701  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  41.24 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  45.36 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  40 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  39.36 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  38.54 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  41.84 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2803  hypothetical protein  40.59 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2672  hypothetical protein  40.59 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2609  hypothetical protein  33.67 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5127  hypothetical protein  39.18 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0017453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  39.36 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1850  hypothetical protein  39.18 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183453  normal  0.129775 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6253  hypothetical protein  39.18 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127485  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1826  hypothetical protein  39.18 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387614  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  42.86 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0255  hypothetical protein  38 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  43.62 
 
 		 101 aa  72  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  38.14 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  38.54 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  40.95 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  39.36 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4005  hypothetical protein  44.12 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2896  hypothetical protein  42.39 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825896  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  38.95 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0807  hypothetical protein  38.95 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237853  hitchhiker  0.000000927658 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  37.86 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2689  hypothetical protein  39.58 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000229424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2573  hypothetical protein  39.58 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2614  hypothetical protein  39.58 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000245202  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  39.58 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  39.58 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  39.22 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  36.46 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1770  hypothetical protein  39.58 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000205784  hitchhiker  0.00167408 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  38 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  39.22 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1860  hypothetical protein  39 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00278106  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>