More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1172 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 262 aa  540  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  74.22 
 
 		 263 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  74.71 
 
 		 273 aa  395  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  71.6 
 
 		 269 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  69.92 
 
 		 263 aa  372  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  63.95 
 
 		 261 aa  349  2e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  64.86 
 
 		 262 aa  340  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  44.13 
 
 		 266 aa  202  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  40.23 
 
 		 268 aa  179  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  38.58 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  40.49 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  40.38 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  39.47 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  37.97 
 
 		 294 aa  169  4e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0563  dimethyladenosine transferase  36.47 
 
 		 271 aa  168  7e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  38.43 
 
 		 291 aa  168  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  39.33 
 
 		 275 aa  168  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  37.26 
 
 		 292 aa  168  9e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  39.1 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  37.74 
 
 		 268 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  37.45 
 
 		 258 aa  166  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  38.85 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  38.91 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  38.67 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  37.93 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  41.53 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  38.72 
 
 		 290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  37.05 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  38.68 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2464  dimethyladenosine transferase  36.22 
 
 		 280 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000579309  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  37.64 
 
 		 268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  38.55 
 
 		 268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  38.71 
 
 		 266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5273  dimethyladenosine transferase  39.36 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  40.8 
 
 		 279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  38.49 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 		 276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  38.35 
 
 		 288 aa  163  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  35.93 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1901  dimethyladenosine transferase  35.74 
 
 		 272 aa  162  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.13527 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  39.33 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3348  dimethyladenosine transferase  38.16 
 
 		 285 aa  161  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.908407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0346  dimethyladenosine transferase  40.49 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335401  normal  0.775767 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  37.65 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0167  dimethyladenosine transferase  40.49 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.314995  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3812  dimethyladenosine transferase  41.15 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  37.25 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  37.8 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  38.67 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1628  dimethyladenosine transferase  41.11 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0961527  hitchhiker  0.00711372 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  35 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  38.29 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  37.26 
 
 		 268 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_002620  TC0633  dimethyladenosine transferase  40.7 
 
 		 277 aa  159  4e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  38.8 
 
 		 297 aa  159  5e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  38.8 
 
 		 297 aa  159  5e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  37.84 
 
 		 296 aa  159  5e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03760  dimethyladenosine transferase  39.84 
 
 		 269 aa  158  7e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1047  dimethyladenosine transferase  35.69 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  37.65 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  38.06 
 
 		 298 aa  157  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  36.47 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0844  dimethyladenosine transferase  38.19 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  37.89 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  36.78 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  36.22 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4526  dimethyladenosine transferase  36.43 
 
 		 301 aa  156  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  38.35 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5760  dimethyladenosine transferase  40.87 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.220306 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0858  dimethyladenosine transferase  35.86 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  36.47 
 
 		 295 aa  156  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  37.41 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  38.87 
 
 		 288 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  37.59 
 
 		 267 aa  155  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3312  dimethyladenosine transferase  38.46 
 
 		 285 aa  155  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809842  normal  0.244834 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  36.68 
 
 		 266 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1559  dimethyladenosine transferase  35.77 
 
 		 281 aa  155  8e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03414  dimethyladenosine transferase  38.46 
 
 		 252 aa  155  9e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  36.96 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  37.02 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  38.87 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  36.78 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  38.2 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1981  dimethyladenosine transferase  41.74 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  38.87 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  36.64 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0563  dimethyladenosine transferase  37.01 
 
 		 272 aa  153  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  38.35 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  37.59 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  37.9 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  37.35 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4074  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  37.97 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  39.69 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735455  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  37.59 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  37.97 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0724  dimethyladenosine transferase  36.08 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682335  normal  0.907502 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  38.58 
 
 		 272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1238  dimethyladenosine transferase  39.18 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 		 267 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>