More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1088 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1088  chaperone protein DnaJ  100 
 
 		 394 aa  806    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.038983  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1872  chaperone protein DnaJ  78.25 
 
 		 395 aa  629  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000340868  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1487  chaperone protein DnaJ  77.53 
 
 		 382 aa  598  1e-170  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.992778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1691  chaperone protein DnaJ  79.55 
 
 		 401 aa  594  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.211452  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1422  chaperone protein DnaJ  76.25 
 
 		 400 aa  591  1e-168  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.234078  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  71.9 
 
 		 395 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1582  chaperone protein DnaJ  70.78 
 
 		 395 aa  556  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  51.26 
 
 		 385 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0071  molecular chaperone, heat shock protein  50.51 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3209  chaperone protein DnaJ  49.37 
 
 		 385 aa  365  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.492328  normal  0.368243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6905  chaperone protein DnaJ  48.99 
 
 		 389 aa  355  1e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.725874  normal  0.252864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4973  chaperone protein DnaJ  47.97 
 
 		 386 aa  345  6e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0482542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1521  chaperone protein DnaJ  47.09 
 
 		 388 aa  345  6e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173202  normal  0.704316 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0979  hypothetical protein  43.51 
 
 		 379 aa  334  2e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127432 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  46.03 
 
 		 380 aa  312  5.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  41.81 
 
 		 375 aa  310  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  43.26 
 
 		 386 aa  306  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  41.31 
 
 		 386 aa  300  2e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  43 
 
 		 384 aa  299  6e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  43.53 
 
 		 382 aa  298  8e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  41.98 
 
 		 379 aa  297  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  44.3 
 
 		 382 aa  296  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  42.64 
 
 		 386 aa  295  7e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  43.94 
 
 		 377 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  42.46 
 
 		 385 aa  294  2e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  42 
 
 		 380 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  41.98 
 
 		 376 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  41.98 
 
 		 376 aa  291  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1082  chaperone protein DnaJ  44.99 
 
 		 369 aa  291  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248799  normal  0.102661 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  41.98 
 
 		 376 aa  291  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  41.98 
 
 		 376 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  41.98 
 
 		 376 aa  291  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  41.98 
 
 		 376 aa  291  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  41.98 
 
 		 376 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  41.98 
 
 		 376 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  41.73 
 
 		 376 aa  290  4e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  40.79 
 
 		 388 aa  288  9e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  42.93 
 
 		 370 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  42.25 
 
 		 384 aa  288  1e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  41.48 
 
 		 379 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  41.88 
 
 		 375 aa  288  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  41.48 
 
 		 379 aa  287  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  41.48 
 
 		 379 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  41.87 
 
 		 375 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  43.54 
 
 		 375 aa  286  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  42.13 
 
 		 373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  40.71 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  40.71 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  40.71 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  40.71 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  40.71 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  43.26 
 
 		 375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3242  chaperone DnaJ  43.69 
 
 		 378 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  41.11 
 
 		 387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  41.11 
 
 		 387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  43 
 
 		 378 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2295  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 		 374 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  41.85 
 
 		 382 aa  280  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  42.75 
 
 		 378 aa  281  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3554  chaperone protein DnaJ  39.34 
 
 		 388 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.562407  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  41.19 
 
 		 356 aa  280  2e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  40.76 
 
 		 373 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  41.62 
 
 		 375 aa  280  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  43.26 
 
 		 374 aa  280  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1438  chaperone protein DnaJ  39.9 
 
 		 374 aa  279  5e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  39.8 
 
 		 379 aa  279  5e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  40.36 
 
 		 377 aa  280  5e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  40.05 
 
 		 375 aa  279  5e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  41.48 
 
 		 372 aa  279  7e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  40.75 
 
 		 381 aa  279  7e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0455  chaperone protein DnaJ  42.28 
 
 		 373 aa  278  8e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  38.29 
 
 		 376 aa  278  9e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0097  chaperone protein DnaJ  41.08 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00841674 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  40.86 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  41.37 
 
 		 376 aa  278  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  40.97 
 
 		 377 aa  278  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  42.13 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1671  chaperone protein DnaJ  41.1 
 
 		 379 aa  278  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  39.69 
 
 		 378 aa  278  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0248  chaperone protein DnaJ  43.19 
 
 		 375 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.821018  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  41.22 
 
 		 374 aa  278  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  39.95 
 
 		 376 aa  278  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1637  chaperone protein DnaJ  41.1 
 
 		 379 aa  278  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.203531  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1776  chaperone protein DnaJ  46.06 
 
 		 383 aa  277  3e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  39.95 
 
 		 378 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  39.95 
 
 		 378 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  39.95 
 
 		 378 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  40.92 
 
 		 356 aa  276  4e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  41.88 
 
 		 374 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  43.72 
 
 		 366 aa  276  4e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  42.24 
 
 		 378 aa  276  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0441  chaperone protein DnaJ  41.27 
 
 		 378 aa  276  4e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000821274  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  39.69 
 
 		 378 aa  276  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  39.95 
 
 		 378 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  41.48 
 
 		 378 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  39.95 
 
 		 378 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  40.3 
 
 		 381 aa  276  6e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  43.65 
 
 		 376 aa  276  6e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  41.88 
 
 		 374 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  40.36 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>