More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1085 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  100 
 
 		 299 aa  611  9.999999999999999e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  58.02 
 
 		 297 aa  363  2e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  61.95 
 
 		 301 aa  351  8.999999999999999e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  59.59 
 
 		 297 aa  342  2.9999999999999997e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  57.91 
 
 		 296 aa  341  1e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  58.82 
 
 		 296 aa  340  2e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  53.61 
 
 		 297 aa  315  8e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  40.89 
 
 		 287 aa  208  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  41.16 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  44.07 
 
 		 279 aa  202  8e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  38.81 
 
 		 285 aa  200  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.16 
 
 		 286 aa  191  9e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  40.48 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  38.89 
 
 		 284 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  40.69 
 
 		 282 aa  188  8e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  40.42 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  38.31 
 
 		 284 aa  186  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  38.57 
 
 		 285 aa  185  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  41.84 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  40.62 
 
 		 285 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  40.07 
 
 		 280 aa  182  7e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  36.08 
 
 		 297 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.93 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  36.95 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.54 
 
 		 285 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.16 
 
 		 279 aa  179  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  36.58 
 
 		 284 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  33.67 
 
 		 361 aa  178  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  34.47 
 
 		 307 aa  177  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  36.52 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  37.46 
 
 		 289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.24 
 
 		 284 aa  172  7.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  39.25 
 
 		 280 aa  170  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  36.21 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  38.89 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  37.89 
 
 		 295 aa  169  7e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  39.08 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  40.44 
 
 		 285 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  37.19 
 
 		 285 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  36.99 
 
 		 297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  36.24 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  39.47 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  35.19 
 
 		 289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  36.59 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  36.26 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.36 
 
 		 295 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.01 
 
 		 288 aa  159  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  37.55 
 
 		 283 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  36.46 
 
 		 288 aa  159  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  38.85 
 
 		 288 aa  158  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  37.92 
 
 		 278 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0166  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.33 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  39.7 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  35.89 
 
 		 283 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.87 
 
 		 283 aa  155  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.31 
 
 		 277 aa  155  7e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  35.54 
 
 		 283 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  35.54 
 
 		 283 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.19 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  35.19 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  39.57 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.19 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  35.19 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5054  HemK family modification methylase  39.04 
 
 		 284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244317  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  38.43 
 
 		 286 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.19 
 
 		 283 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  35.56 
 
 		 277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  41.55 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  39.63 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  37.8 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  38.2 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  34.49 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  37.55 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0303  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.02 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0701  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.34 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.84 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  36.52 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  36.52 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  38.2 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  35.19 
 
 		 277 aa  149  5e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  38.24 
 
 		 289 aa  149  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  36.33 
 
 		 280 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  36.2 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.55 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.97 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  33.9 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.97 
 
 		 280 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  34.86 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  39.03 
 
 		 280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.98 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000794612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  30.82 
 
 		 359 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2220  modification methylase, HemK family  32.45 
 
 		 286 aa  145  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.018393 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  35.88 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1234  HemK family modification methylase  37.41 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0042  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.53 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.24008 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  30.18 
 
 		 345 aa  143  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  34.21 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.5 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  36.71 
 
 		 275 aa  143  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2258  hypothetical protein  35.45 
 
 		 287 aa  142  5e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>