More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1060 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1060  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 		 526 aa  1065    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1887  apolipoprotein N-acyltransferase  59.22 
 
 		 560 aa  650    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1703  apolipoprotein N-acyltransferase  58.49 
 
 		 545 aa  623  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00015013  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  57.01 
 
 		 554 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1330  apolipoprotein N-acyltransferase  57.42 
 
 		 519 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17082  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1594  apolipoprotein N-acyltransferase  52.85 
 
 		 537 aa  547  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.953743 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0842  apolipoprotein N-acyltransferase  52.59 
 
 		 537 aa  534  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3257  apolipoprotein N-acyltransferase  31.5 
 
 		 533 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6937  apolipoprotein N-acyltransferase  29.75 
 
 		 538 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.207739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  30.36 
 
 		 507 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  29.98 
 
 		 507 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  30.94 
 
 		 521 aa  203  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  30 
 
 		 521 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  32.57 
 
 		 516 aa  197  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  31.12 
 
 		 525 aa  193  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  30.59 
 
 		 506 aa  190  7e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12383  Apolipoprotein N-acyltransferase  27.73 
 
 		 527 aa  188  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0630157  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  31.85 
 
 		 477 aa  183  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  30.58 
 
 		 529 aa  183  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0412  apolipoprotein N-acyltransferase  27.46 
 
 		 539 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.107185 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  26.56 
 
 		 532 aa  178  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  30.57 
 
 		 510 aa  177  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2299  apolipoprotein N-acyltransferase  27.6 
 
 		 525 aa  172  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  29.14 
 
 		 542 aa  171  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  28.22 
 
 		 526 aa  160  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  26.2 
 
 		 513 aa  157  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  27.53 
 
 		 536 aa  153  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  29 
 
 		 528 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  29 
 
 		 502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  25.92 
 
 		 520 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  33.46 
 
 		 505 aa  148  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1708  apolipoprotein N-acyltransferase  27.09 
 
 		 544 aa  147  4.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00863379  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  26.68 
 
 		 553 aa  147  5e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  26.95 
 
 		 528 aa  147  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  29.18 
 
 		 535 aa  146  9e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0178  apolipoprotein N-acyltransferase  30.79 
 
 		 501 aa  146  1e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  29.9 
 
 		 522 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  26.57 
 
 		 532 aa  141  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  26.67 
 
 		 541 aa  141  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  27.14 
 
 		 534 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  28.9 
 
 		 536 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1977  apolipoprotein N-acyltransferase  28.35 
 
 		 530 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.925969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3440  apolipoprotein N-acyltransferase  27.53 
 
 		 514 aa  136  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.79664e-23 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  28.89 
 
 		 536 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  27.13 
 
 		 534 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1507  apolipoprotein N-acyltransferase  27.56 
 
 		 501 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  29.63 
 
 		 536 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0821  apolipoprotein N-acyltransferase  28.13 
 
 		 518 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1912  apolipoprotein N-acyltransferase  31.44 
 
 		 537 aa  131  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000101188  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0986  apolipoprotein N-acyltransferase  24.56 
 
 		 760 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  28.16 
 
 		 497 aa  130  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  27.38 
 
 		 534 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1679  apolipoprotein N-acyltransferase  29.06 
 
 		 550 aa  128  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  25.23 
 
 		 532 aa  128  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  28.74 
 
 		 520 aa  127  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  30.28 
 
 		 543 aa  128  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  25.66 
 
 		 524 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2913  apolipoprotein N-acyltransferase  31.13 
 
 		 505 aa  127  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0363  apolipoprotein N-acyltransferase  27.81 
 
 		 487 aa  127  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2717  apolipoprotein N-acyltransferase  27.65 
 
 		 589 aa  127  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.419709  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3304  apolipoprotein N-acyltransferase  25.05 
 
 		 521 aa  126  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1937  apolipoprotein N-acyltransferase  26.95 
 
 		 552 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1814  apolipoprotein N-acyltransferase  28.77 
 
 		 540 aa  126  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136968  normal  0.226792 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  29.48 
 
 		 524 aa  126  9e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  25.05 
 
 		 532 aa  126  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  30.24 
 
 		 531 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2902  apolipoprotein N-acyltransferase  27.79 
 
 		 590 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  29.68 
 
 		 500 aa  125  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  26.1 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  31.94 
 
 		 576 aa  125  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0151  apolipoprotein N-acyltransferase  25.67 
 
 		 475 aa  124  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.721179  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4108  apolipoprotein N-acyltransferase  27.56 
 
 		 530 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0125934  decreased coverage  0.00767945 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2809  apolipoprotein N-acyltransferase  27.6 
 
 		 590 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  28.79 
 
 		 515 aa  124  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  28.3 
 
 		 557 aa  123  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0222  apolipoprotein N-acyltransferase  23.92 
 
 		 491 aa  123  7e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4417  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3232  apolipoprotein N-acyltransferase  25.72 
 
 		 634 aa  123  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40392  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0345  apolipoprotein N-acyltransferase  27.43 
 
 		 487 aa  123  8e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  25.1 
 
 		 541 aa  122  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  29.46 
 
 		 506 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  28.72 
 
 		 522 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  28.3 
 
 		 524 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  27.17 
 
 		 524 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1141  apolipoprotein N-acyltransferase  32.42 
 
 		 464 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0258943  normal  0.332903 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  27.88 
 
 		 514 aa  121  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  29.46 
 
 		 479 aa  121  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  28.75 
 
 		 519 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  26.83 
 
 		 519 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  27.33 
 
 		 512 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  26.55 
 
 		 485 aa  120  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.285034  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  27.33 
 
 		 508 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  26.96 
 
 		 543 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  0.00000000000481156 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  28.68 
 
 		 516 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  27.37 
 
 		 523 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111383 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  29.38 
 
 		 512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  29.66 
 
 		 512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  29.38 
 
 		 512 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  31.75 
 
 		 567 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02234  apolipoprotein N-acyltransferase  29.5 
 
 		 504 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21676  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  29.58 
 
 		 553 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>