247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1046 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 368 aa  746    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251209  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  66.76 
 
 		 363 aa  512  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  53.17 
 
 		 364 aa  376  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  53.17 
 
 		 364 aa  376  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  52.6 
 
 		 369 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  52.46 
 
 		 369 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  51.78 
 
 		 369 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  52.05 
 
 		 369 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.48 
 
 		 364 aa  326  5e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  46.24 
 
 		 360 aa  317  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  46.11 
 
 		 367 aa  311  9e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.710337 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  45.56 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.56 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  45.56 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  45.56 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  45.56 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  45.56 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  45.56 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  45.28 
 
 		 367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.75 
 
 		 368 aa  310  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  45.28 
 
 		 367 aa  309  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  44.88 
 
 		 367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  44.88 
 
 		 367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  44.9 
 
 		 367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  44.9 
 
 		 367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4514  glycerol dehydrogenase  44.88 
 
 		 367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000391797 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  45.33 
 
 		 360 aa  306  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  45.53 
 
 		 376 aa  297  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  46.07 
 
 		 364 aa  293  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.08 
 
 		 366 aa  288  7e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  43.82 
 
 		 365 aa  285  9e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  42.03 
 
 		 395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.25 
 
 		 373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  42.15 
 
 		 362 aa  281  1e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0519  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.62 
 
 		 374 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  42.46 
 
 		 366 aa  276  3e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.29 
 
 		 380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.28 
 
 		 385 aa  272  7e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  41.21 
 
 		 383 aa  271  9e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5962  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.38 
 
 		 365 aa  267  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.31 
 
 		 364 aa  265  1e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0772  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.78 
 
 		 367 aa  258  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.277229  normal  0.0195639 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2346  glycerol dehydrogenase  37.43 
 
 		 367 aa  249  5e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6106  glycerol dehydrogenase  42.5 
 
 		 374 aa  242  7.999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25848  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  42.68 
 
 		 398 aa  237  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3356  glycerol dehydrogenase  42.19 
 
 		 371 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1007  glycerol dehydrogenase  41.83 
 
 		 371 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.15 
 
 		 383 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2945  glycerol dehydrogenase  41.83 
 
 		 372 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1019  glycerol dehydrogenase  41.55 
 
 		 371 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.556711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0985  glycerol dehydrogenase  41.27 
 
 		 371 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  33.7 
 
 		 379 aa  219  7e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  38.02 
 
 		 365 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  35.46 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.87 
 
 		 363 aa  205  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1883  glycerol dehydrogenase  37.39 
 
 		 371 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4666  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5662  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.47 
 
 		 364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1714  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.03 
 
 		 362 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.78 
 
 		 377 aa  170  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0011  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.01 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556568  normal  0.0107863 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.92 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3601  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.45 
 
 		 384 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.48 
 
 		 373 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.55 
 
 		 373 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0902  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 		 373 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  33.99 
 
 		 359 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.72 
 
 		 378 aa  149  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1794  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.48 
 
 		 367 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1388  putative glycerol dehydrogenase  30.28 
 
 		 366 aa  146  5e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.106406  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09901  putative glycerol dehydrogenase  30.52 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2634  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.83 
 
 		 360 aa  142  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1396  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.25 
 
 		 367 aa  142  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  26.85 
 
 		 364 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1650  glycerol dehydrogenase  32.97 
 
 		 359 aa  137  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 		 339 aa  132  6.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2414  hypothetical protein  34.35 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0620  hypothetical protein  32.01 
 
 		 362 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14931  putative glycerol dehydrogenase  27.6 
 
 		 372 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0502  hypothetical protein  30.77 
 
 		 362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0661  glycerol dehydrogenase family protein  27.52 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3025  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.68 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0651  hypothetical protein  31.68 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3044  hypothetical protein  31.68 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2422  hypothetical protein  32.89 
 
 		 363 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3080  hypothetical protein  32.89 
 
 		 363 aa  126  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2519  hypothetical protein  32.89 
 
 		 363 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113395  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00567  predicted oxidoreductase  29.81 
 
 		 362 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1626  putative glycerol dehydrogenase  29.56 
 
 		 366 aa  125  9e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.234673  normal  0.71595 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00556  hypothetical protein  29.81 
 
 		 362 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730411  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0685  hypothetical protein  32.08 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0620  hypothetical protein  29.38 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11941  putative glycerol dehydrogenase  28.96 
 
 		 363 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0051  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.79 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00126649  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11931  putative glycerol dehydrogenase  29.73 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.273319  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2371  hypothetical protein  33.33 
 
 		 362 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0760  hypothetical protein  29.38 
 
 		 362 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0655  hypothetical protein  31.27 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4190  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.88 
 
 		 358 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>