More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1040 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
517 aa  1068    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  44.5 
 
 
586 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  51.06 
 
 
826 aa  276  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  52.38 
 
 
751 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  51.84 
 
 
433 aa  268  2e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  51.76 
 
 
325 aa  267  4e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  51.66 
 
 
517 aa  263  4e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  48.18 
 
 
829 aa  259  8e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  52.45 
 
 
267 aa  246  8e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  45.82 
 
 
742 aa  238  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  45.73 
 
 
398 aa  229  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  46.49 
 
 
319 aa  226  8e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  45.58 
 
 
398 aa  223  8e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  39.62 
 
 
1132 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  41.15 
 
 
617 aa  194  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  42.49 
 
 
892 aa  191  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  38.1 
 
 
603 aa  190  5e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  42.58 
 
 
636 aa  189  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  43.02 
 
 
620 aa  188  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  34.91 
 
 
882 aa  186  8e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  42.15 
 
 
740 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  39.78 
 
 
625 aa  183  8.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  42.52 
 
 
358 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  42.29 
 
 
269 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  41.29 
 
 
527 aa  179  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  38.85 
 
 
1911 aa  178  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  41.09 
 
 
593 aa  178  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1939  glycoside hydrolase family 16  43.16 
 
 
566 aa  178  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600804  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  41.67 
 
 
862 aa  178  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  41.73 
 
 
820 aa  177  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  41.09 
 
 
621 aa  176  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  37.25 
 
 
802 aa  174  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  40.78 
 
 
637 aa  174  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  39.92 
 
 
623 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  38.25 
 
 
781 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  38.26 
 
 
877 aa  172  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  38.81 
 
 
1196 aa  171  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  39.92 
 
 
925 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  38.01 
 
 
654 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  36.1 
 
 
351 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  38.08 
 
 
929 aa  167  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  36.1 
 
 
538 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  41.09 
 
 
637 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  40.66 
 
 
522 aa  164  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  38.37 
 
 
618 aa  164  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  38.01 
 
 
616 aa  163  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  26.39 
 
 
584 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  33.76 
 
 
453 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  36.46 
 
 
1104 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  36.72 
 
 
346 aa  160  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  37.41 
 
 
664 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  37.06 
 
 
305 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  39.54 
 
 
620 aa  157  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.36 
 
 
554 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  33.92 
 
 
287 aa  155  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  36.68 
 
 
426 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  38.43 
 
 
287 aa  154  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  38.17 
 
 
281 aa  152  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  36.86 
 
 
416 aa  151  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  39.68 
 
 
293 aa  151  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  37.55 
 
 
289 aa  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.23 
 
 
303 aa  143  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  32.45 
 
 
359 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.74 
 
 
349 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  36.61 
 
 
668 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  35 
 
 
338 aa  139  7.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  35.32 
 
 
639 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  35.32 
 
 
639 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  38.78 
 
 
692 aa  137  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
308 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  30.41 
 
 
489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  38.19 
 
 
292 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  32.75 
 
 
334 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2020  protein of unknown function DUF323  33.46 
 
 
292 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1993  protein of unknown function DUF323  33.46 
 
 
292 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  33.89 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  32.62 
 
 
338 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  36.47 
 
 
509 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2941  hypothetical protein  43.97 
 
 
286 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  32.46 
 
 
312 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  33.87 
 
 
384 aa  130  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  32.98 
 
 
336 aa  130  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  34.04 
 
 
600 aa  130  8.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  32.23 
 
 
348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  38.15 
 
 
291 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  34.04 
 
 
549 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  35.69 
 
 
768 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  35.57 
 
 
587 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  32.44 
 
 
331 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  34.92 
 
 
319 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  34.39 
 
 
301 aa  127  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  29.92 
 
 
952 aa  127  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  34.91 
 
 
300 aa  126  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  32.94 
 
 
446 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  34.9 
 
 
491 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.45 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  33.2 
 
 
288 aa  123  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  31.31 
 
 
390 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  43.18 
 
 
360 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  30.89 
 
 
279 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>