More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1034 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 474 aa  976    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  72.98 
 
 		 478 aa  717    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  80.13 
 
 		 472 aa  792    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  71.37 
 
 		 472 aa  699    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  82.91 
 
 		 473 aa  813    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  87.63 
 
 		 476 aa  862    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  71.86 
 
 		 477 aa  702    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  58.15 
 
 		 471 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0215  Radical SAM domain protein  57.17 
 
 		 483 aa  559  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2351  Radical SAM domain protein  57.39 
 
 		 470 aa  552  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0104  Elongator protein 3/MiaB/NifB  57.02 
 
 		 471 aa  553  1e-156  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.016324  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2462  radical SAM domain-containing protein  54.72 
 
 		 480 aa  536  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  57.02 
 
 		 479 aa  529  1e-149  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  53.65 
 
 		 475 aa  525  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000436427  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  35.81 
 
 		 433 aa  234  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  31.61 
 
 		 439 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1700  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  32.1 
 
 		 434 aa  217  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000292659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  31.14 
 
 		 444 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  31.42 
 
 		 444 aa  209  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  30.34 
 
 		 459 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  32.84 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  30.05 
 
 		 428 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  30.45 
 
 		 426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  31.38 
 
 		 428 aa  196  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  30.31 
 
 		 434 aa  196  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  27.68 
 
 		 448 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  31.3 
 
 		 446 aa  192  8e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  30.02 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  27.85 
 
 		 428 aa  188  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  33.06 
 
 		 502 aa  182  9.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2599  radical SAM domain-containing protein  29.06 
 
 		 486 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  27.97 
 
 		 462 aa  179  7e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  31.79 
 
 		 509 aa  179  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0021  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 		 445 aa  177  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  32.24 
 
 		 520 aa  176  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  25.45 
 
 		 449 aa  173  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  32.18 
 
 		 498 aa  172  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  32.24 
 
 		 500 aa  170  6e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1459  Radical SAM domain protein  28.16 
 
 		 477 aa  170  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.71373  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  29.4 
 
 		 433 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2428  radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 		 477 aa  166  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000104661  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0931  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.7 
 
 		 465 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.988397  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1466  Radical SAM domain protein  26.77 
 
 		 467 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1537  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.01 
 
 		 462 aa  162  9e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.537529  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1023  Radical SAM domain protein  27.57 
 
 		 467 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1516  Radical SAM domain protein  26.52 
 
 		 469 aa  161  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0112694  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  24.88 
 
 		 441 aa  160  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1644  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 		 468 aa  156  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 		 471 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 		 471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1318  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.96 
 
 		 471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1617  Radical SAM domain protein  26.43 
 
 		 469 aa  152  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0136432  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  28.88 
 
 		 504 aa  147  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0940  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.03 
 
 		 461 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.481544 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0919  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 		 422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  29.1 
 
 		 501 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2971  radical SAM family protein  28.95 
 
 		 504 aa  144  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0407  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.76 
 
 		 466 aa  143  8e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1806  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3135  radical SAM family Fe-S protein  25.78 
 
 		 490 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2731  Radical SAM domain protein  27.13 
 
 		 465 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3555  Radical SAM domain protein  30.9 
 
 		 448 aa  139  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  26.85 
 
 		 493 aa  139  8.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1975  Radical SAM domain protein  27.51 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00675749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 		 527 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  28.61 
 
 		 523 aa  139  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  26.57 
 
 		 529 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0200  radical SAM domain-containing protein  28.19 
 
 		 468 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0997671  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1159  Radical SAM domain protein  26.91 
 
 		 502 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0267  Radical SAM domain protein  26.65 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0513  radical SAM domain-containing protein  32.65 
 
 		 445 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000241934  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  24.57 
 
 		 522 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  29.19 
 
 		 503 aa  133  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0548  radical SAM domain-containing protein  26.46 
 
 		 504 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0116  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.03 
 
 		 461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0738  Radical SAM domain protein  26.52 
 
 		 525 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.170027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  26.65 
 
 		 533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 		 468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 		 490 aa  131  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  25.31 
 
 		 529 aa  130  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  27.43 
 
 		 600 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  27.32 
 
 		 512 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2757  Radical SAM domain protein  25.43 
 
 		 462 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3848  hypothetical protein  28.93 
 
 		 532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0151131  normal  0.930541 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  24.94 
 
 		 529 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1063  radical SAM domain protein  29.32 
 
 		 503 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000246609  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  27.3 
 
 		 533 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4335  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 498 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1091  radical SAM domain-containing protein  29.08 
 
 		 503 aa  127  5e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0346077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0364  radical SAM domain-containing protein  27.04 
 
 		 543 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3556  Radical SAM domain protein  28.28 
 
 		 450 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1163  Radical SAM domain protein  28 
 
 		 444 aa  123  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5391  Radical SAM domain protein  25.3 
 
 		 471 aa  122  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  26.56 
 
 		 529 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  26.96 
 
 		 542 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3535  Radical SAM domain protein  30.24 
 
 		 444 aa  120  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02131  Fe-S oxidoreductase  24.35 
 
 		 524 aa  120  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  24.09 
 
 		 527 aa  116  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4012  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4381  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>