More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1030 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1030  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 84 aa  169  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011666  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1712  50S ribosomal protein L27  94.05 
 
 		 84 aa  161  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.592545  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0863  50S ribosomal protein L27  90.48 
 
 		 85 aa  159  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0966779  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1509  50S ribosomal protein L27  91.67 
 
 		 84 aa  158  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00258122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1899  50S ribosomal protein L27  85.71 
 
 		 84 aa  149  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.617273  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1602  50S ribosomal protein L27  85.71 
 
 		 84 aa  149  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0833  50S ribosomal protein L27  77.38 
 
 		 84 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.5816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  110  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 92 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 92 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  71.83 
 
 		 91 aa  107  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4217  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  106  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0838  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3276  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212602 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  59.77 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0896  ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000144427  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0771  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2128  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 88 aa  105  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.861173  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0842  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.987021  normal  0.6635 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1326  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019115  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  103  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000226179  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3674  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  103  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1137  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  103  9e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00024272  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0512  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2046  ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1269  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 85 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000774064  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000249957  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13991  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.228123 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0750  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00233026 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 87 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 92 aa  101  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0213  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 86 aa  101  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.280528 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4883  ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 92 aa  101  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113157  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1526  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0916  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1583  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0195  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 86 aa  101  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000826463  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17721  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2480  ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.782187  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0545  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3916  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00853508 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 85 aa  100  6e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  69.57 
 
 		 86 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 95 aa  100  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1280  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 84 aa  100  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00391085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 84 aa  100  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 82 aa  100  9e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15061  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 86 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.610968  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 87 aa  99.8  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 93 aa  99.4  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  55.95 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 85 aa  98.6  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0892  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670599 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5485  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 85 aa  98.6  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.132015  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0019  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 86 aa  99  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0750  ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000003902  hitchhiker  0.00471075 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  57.65 
 
 		 85 aa  98.6  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15311  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 86 aa  98.2  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.854601  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1482  50S ribosomal protein L27  58.54 
 
 		 93 aa  98.2  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  97.8  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  97.8  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 88 aa  98.2  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15461  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 86 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.120914  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  97.8  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 89 aa  98.2  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0456  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 96 aa  97.8  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.031206  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1749  50S ribosomal protein L27  65.33 
 
 		 83 aa  97.4  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000203988  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 93 aa  97.4  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1443  50S ribosomal protein L27  60.47 
 
 		 86 aa  97.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 		 89 aa  97.8  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  97.4  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>